Subversion Repositories f9daq

Rev

Rev 172 | Go to most recent revision | Blame | Compare with Previous | Last modification | View Log | RSS feed

  1. #include "../include/sipmscan.h"
  2. #include "../include/workstation.h"
  3.  
  4. #include <stdio.h>
  5. #include <stdlib.h>
  6.  
  7. int retTemp;
  8.  
  9. // Additional functions -------------------------------------
  10.  
  11. // Display the currently selected histogram in the file list
  12. void TGAppMainFrame::DisplayHistogram(char *histfile, int histtype, int opt)
  13. {
  14.    char histtime[256];
  15.    char ctemp[512];
  16.  
  17.    if(DBGSIG)
  18.       printf("DisplayHistogram(): Selected file: %s\n", histfile);
  19.  
  20.    TCanvas *gCanvas = analysisCanvas->GetCanvas();
  21.  
  22.    inroot = TFile::Open(histfile, "READ");
  23.  
  24.    TTree *header_data, *meas_data;
  25.    inroot->GetObject("header_data", header_data);
  26.    inroot->GetObject("meas_data", meas_data);
  27.  
  28.    // Reading the header
  29.    header_data->SetBranchAddress("nrch", &evtheader.nrch);
  30.    header_data->GetEntry(0);
  31.    header_data->SetBranchAddress("timestamp", &evtheader.timestamp);
  32.    header_data->GetEntry(0);
  33.    header_data->SetBranchAddress("biasvolt", &evtheader.biasvolt);
  34.    header_data->GetEntry(0);
  35.    header_data->SetBranchAddress("xpos", &evtheader.xpos);
  36.    header_data->GetEntry(0);
  37.    header_data->SetBranchAddress("ypos", &evtheader.ypos);
  38.    header_data->GetEntry(0);
  39.    header_data->SetBranchAddress("zpos", &evtheader.zpos);
  40.    header_data->GetEntry(0);
  41.    header_data->SetBranchAddress("temperature", &evtheader.temperature);
  42.    header_data->GetEntry(0);
  43.    if( header_data->FindBranch("angle") )
  44.    {
  45.       header_data->SetBranchAddress("angle", &evtheader.angle);
  46.       header_data->GetEntry(0);
  47.    }
  48.    header_data->SetBranchAddress("laserinfo", &evtheader.laserinfo);
  49.    header_data->GetEntry(0);
  50.  
  51.    // Change timestamp to local time
  52.    GetTime(evtheader.timestamp, histtime);
  53.  
  54.    // Displaying header information debug
  55.    if(DBGSIG)
  56.    {
  57.       printf("DisplayHistogram(): Opened file header information:\n");
  58.       printf("- Number of channels (ADC and TDC are considered as separate channels): %d\n", evtheader.nrch);
  59.       printf("- Timestamp: %d (%s)\n", evtheader.timestamp, histtime);
  60.       printf("- Bias voltage: %lf\n", evtheader.biasvolt);
  61.       printf("- Table position (X,Y,Z): %d, %d, %d\n", evtheader.xpos, evtheader.ypos, evtheader.zpos);
  62.       if(evtheader.temperature)
  63.          printf("- Temperature: %lf\n", evtheader.temperature);
  64.       if( header_data->FindBranch("angle") )
  65.          printf("- Incidence angle: %lf\n", evtheader.angle);
  66.       else
  67.          printf("- Incidence angle: No angle information!\n");
  68.       printf("- Laser and filter settings: %s\n", evtheader.laserinfo);
  69.    }
  70.  
  71.    // Displaying header information on the GUI
  72.    dispTime->widgetTE->SetText(histtime);
  73.    dispBias->widgetNE[0]->SetNumber(evtheader.biasvolt);
  74.    sprintf(ctemp, "%d, %d, %d", evtheader.xpos, evtheader.ypos, evtheader.zpos);
  75.    dispPos->widgetTE->SetText(ctemp);
  76.    if(evtheader.temperature)
  77.       dispTemp->widgetNE[0]->SetNumber(evtheader.temperature);
  78.    else
  79.       dispTemp->widgetNE[0]->SetNumber(0.0);
  80.    if( header_data->FindBranch("angle") )
  81.       dispAngle->widgetNE[0]->SetNumber(evtheader.angle);
  82.    else
  83.       dispAngle->widgetNE[0]->SetNumber(0.0);
  84.    dispLaser->widgetTE->SetText(evtheader.laserinfo);
  85.  
  86.    selectCh->widgetNE[0]->SetLimitValues(0, (evtheader.nrch/2)-1);
  87.  
  88.    // Redraw the histograms
  89.    int j;
  90.    char rdc[256];
  91.    char rdcsel[256];
  92.  
  93.    j = selectCh->widgetNE[0]->GetNumber();
  94.  
  95.    printf("Found %d data points.\n", (int)meas_data->GetEntries());
  96.  
  97.    gCanvas->cd();
  98.    double range[4];
  99.    range[0] = adcRange->widgetNE[0]->GetNumber();
  100.    range[1] = adcRange->widgetNE[1]->GetNumber();
  101.    range[2] = tdcRange->widgetNE[0]->GetNumber();
  102.    range[3] = tdcRange->widgetNE[1]->GetNumber();
  103.  
  104.    // ADC histogram
  105.    if(histtype == 0)
  106.    {
  107.       if( range[0] == range[1] )
  108.          sprintf(rdc, "ADC%d>>%s", j, histname);
  109.       else
  110.          sprintf(rdc, "ADC%d>>%s(%d,%lf,%lf)", j, histname, (int)(range[1]-range[0]), range[0]-0.5, range[1]-0.5);
  111.  
  112.       sprintf(rdcsel, "(TDC%d>%lf)&&(TDC%d<%lf)", j, range[2]*tdctimeconversion, j, range[3]*tdctimeconversion);
  113.       meas_data->Draw(rdc, rdcsel);
  114.  
  115.       sprintf(rdc, "ADC%d, Vbias=%.3lf, TDC=(%.2lf,%.2lf);ADC;", j, evtheader.biasvolt, range[2], range[3]);
  116.       TH1F *histtemp = (TH1F*)gCanvas->GetPrimitive(histname);
  117.       if(!cleanPlots)
  118.          histtemp->SetTitle(rdc);
  119.       else
  120.          histtemp->SetTitle(";ADC;");
  121.       histtemp->GetXaxis()->SetLabelSize(0.025);
  122.       histtemp->GetXaxis()->CenterTitle(kTRUE);
  123.       histtemp->GetYaxis()->SetLabelSize(0.025);
  124.       if(cleanPlots)
  125.       {
  126.          TGaxis *yax = (TGaxis*)histtemp->GetYaxis();
  127.          yax->SetMaxDigits(4);
  128.       }
  129.  
  130.       gCanvas->Modified();
  131.       gCanvas->Update();
  132.  
  133.       if( yRange->widgetNE[0]->GetNumber() != yRange->widgetNE[1]->GetNumber() )
  134.       {
  135.          if( (histOpt->widgetChBox[0]->IsDown()) && (yRange->widgetNE[0]->GetNumber() <= 0) )
  136.          {
  137.             histtemp->GetYaxis()->SetRangeUser(0.5, yRange->widgetNE[1]->GetNumber());
  138.             yRange->widgetNE[0]->SetNumber(0.5);
  139.             logChange = 1;
  140.          }
  141.          else
  142.          {
  143.             gCanvas->SetLogy(kFALSE);
  144.             if(logChange == 1)
  145.             {
  146.                yRange->widgetNE[0]->SetNumber(0.0);
  147.                logChange = 0;
  148.             }
  149.             histtemp->GetYaxis()->SetRangeUser(yRange->widgetNE[0]->GetNumber(), yRange->widgetNE[1]->GetNumber());
  150.          }
  151.       }
  152.  
  153.       TPaveStats *stats = (TPaveStats*)histtemp->FindObject("stats");
  154.       if(!cleanPlots)
  155.       {
  156.          stats->SetX1NDC(0.84); stats->SetX2NDC(0.97);
  157.          stats->SetY1NDC(0.87); stats->SetY2NDC(0.97);
  158.       }
  159.       else
  160.       {
  161.          stats->SetX1NDC(1.1); stats->SetX2NDC(1.3);
  162.          stats->SetY1NDC(1.1); stats->SetY2NDC(1.3);
  163.       }
  164.    }
  165.    // TDC histogram
  166.    else if(histtype == 1)
  167.    {
  168.       if( range[0] == range[1] )
  169.          sprintf(rdc, "(TDC%d/%lf)>>%s", j, tdctimeconversion, histname);
  170.       else
  171.          sprintf(rdc, "(TDC%d/%lf)>>%s(%d,%lf,%lf)", j, tdctimeconversion, histname, (int)((range[3]-range[2])*tdctimeconversion), range[2], range[3]);
  172.  
  173.       sprintf(rdcsel, "(TDC%d>%lf)&&(TDC%d<%lf)", j, range[2]*tdctimeconversion, j, range[3]*tdctimeconversion);
  174.       meas_data->Draw(rdc, rdcsel);
  175.  
  176.       sprintf(rdc, "TDC%d, Vbias=%.3lf, TDC=(%.2lf,%.2lf);Time (TDC channel) [ns];", j, evtheader.biasvolt, range[2], range[3]);
  177.       TH1F *histtemp = (TH1F*)gCanvas->GetPrimitive(histname);
  178.       if(!cleanPlots)
  179.          histtemp->SetTitle(rdc);
  180.       else
  181.          histtemp->SetTitle(";Time (TDC channel) [ns];");
  182.       histtemp->GetXaxis()->SetLabelSize(0.025);
  183.       histtemp->GetXaxis()->CenterTitle(kTRUE);
  184.       histtemp->GetYaxis()->SetLabelSize(0.025);
  185.       if(cleanPlots)
  186.       {
  187.          TGaxis *yax = (TGaxis*)histtemp->GetYaxis();
  188.          yax->SetMaxDigits(4);
  189.       }
  190.  
  191.       gCanvas->Modified();
  192.       gCanvas->Update();
  193.  
  194.       if( yRange->widgetNE[0]->GetNumber() != yRange->widgetNE[1]->GetNumber() )
  195.       {
  196.          if( (histOpt->widgetChBox[0]->IsDown()) && (yRange->widgetNE[0]->GetNumber() <= 0) )
  197.          {
  198.             histtemp->GetYaxis()->SetRangeUser(0.5, yRange->widgetNE[1]->GetNumber());
  199.             yRange->widgetNE[0]->SetNumber(0.5);
  200.             logChange = 1;
  201.          }
  202.          else
  203.          {
  204.             gCanvas->SetLogy(kFALSE);
  205.             if(logChange == 1)
  206.             {
  207.                yRange->widgetNE[0]->SetNumber(0.0);
  208.                logChange = 0;
  209.             }
  210.             histtemp->GetYaxis()->SetRangeUser(yRange->widgetNE[0]->GetNumber(), yRange->widgetNE[1]->GetNumber());
  211.          }
  212.       }
  213.  
  214.       TPaveStats *stats = (TPaveStats*)histtemp->FindObject("stats");
  215.       if(!cleanPlots)
  216.       {
  217.          stats->SetX1NDC(0.84); stats->SetX2NDC(0.97);
  218.          stats->SetY1NDC(0.87); stats->SetY2NDC(0.97);
  219.       }
  220.       else
  221.       {
  222.          stats->SetX1NDC(1.1); stats->SetX2NDC(1.3);
  223.          stats->SetY1NDC(1.1); stats->SetY2NDC(1.3);
  224.       }
  225.    }
  226.    // ADC vs. TDC histogram
  227.    else if(histtype == 2)
  228.    {
  229.       if( ((range[0] == range[1]) && (range[2] == range[3])) || (range[2] == range[3]) || (range[0] == range[1]) )
  230.          sprintf(rdc, "(TDC%d/%lf):ADC%d>>%s", j, tdctimeconversion, j, histname);
  231.       else
  232.          sprintf(rdc, "(TDC%d/%lf):ADC%d>>%s(%d,%lf,%lf,%d,%lf,%lf)", j, tdctimeconversion, j, histname, (int)(range[1]-range[0])/2, range[0]-0.5, range[1]-0.5, (int)((range[3]-range[2])*tdctimeconversion)/2, range[2], range[3]);
  233.       meas_data->Draw(rdc,"","COLZ");
  234.  
  235.       sprintf(rdc, "ADC/TDC%d, Vbias=%.3lf, TDC=(%.2lf,%.2lf);ADC;TDC", j, evtheader.biasvolt, range[2], range[3]);
  236.       TH2F *histtemp = (TH2F*)gCanvas->GetPrimitive(histname);
  237.       if(!cleanPlots)
  238.          histtemp->SetTitle(rdc);
  239.       else
  240.          histtemp->SetTitle(";ADC;Time (TDC channel) [ns]");
  241.       histtemp->GetXaxis()->SetLabelSize(0.025);
  242.       histtemp->GetXaxis()->CenterTitle(kTRUE);
  243.       histtemp->GetYaxis()->SetLabelSize(0.025);
  244.       histtemp->GetYaxis()->CenterTitle(kTRUE);
  245.       histtemp->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.35);
  246.       if(cleanPlots)
  247.       {
  248.          TGaxis *yax = (TGaxis*)histtemp->GetYaxis();
  249.          yax->SetMaxDigits(4);
  250.       }
  251.  
  252.       gCanvas->Modified();
  253.       gCanvas->Update();
  254.  
  255.       TPaveStats *stats = (TPaveStats*)histtemp->FindObject("stats");
  256.       stats->SetX1NDC(1.1); stats->SetX2NDC(1.3);
  257.       stats->SetY1NDC(1.1); stats->SetY2NDC(1.3);
  258.  
  259.       TPaletteAxis *gpalette = (TPaletteAxis*)histtemp->GetListOfFunctions()->FindObject("palette");
  260.       gpalette->SetLabelSize(0.022);
  261.    }
  262.  
  263.    if(histtype < 2)
  264.    {
  265.       if( histOpt->widgetChBox[0]->IsDown() )
  266.          gCanvas->SetLogy(kTRUE);
  267.       else if( !histOpt->widgetChBox[0]->IsDown() )
  268.          gCanvas->SetLogy(kFALSE);
  269.    }
  270.    else
  271.       gCanvas->SetLogy(kFALSE);
  272.  
  273.    gCanvas->Modified();
  274.    gCanvas->Update();
  275.  
  276.    delete header_data;
  277.    delete meas_data;
  278.  
  279.    // Delete the opened file when we just display it in the analysis canvas (otherwise wait for histogram save)
  280.    if(opt != 1)
  281.       delete inroot;
  282.  
  283.    // If you close the opened file (delete inroot), the data can not be accessed by other functions (any time we wish to use the data directly from histogram, we need to call the DisplayHistogram function -> using different opt to determine what we need to do)
  284. }
  285.  
  286. // Start a measurement (acquisition from CAMAC)
  287. void TGAppMainFrame::RunMeas(void *ptr, int runCase, int &scanon)
  288. {
  289.    int vscan = 0, pscan = 0, zscan = 0, ascan = 0;
  290.    if(scansOn->widgetChBox[0]->IsDown()) vscan = 1;
  291.    if(scansOn->widgetChBox[1]->IsDown()) pscan = 1;
  292.    if(scansOn->widgetChBox[2]->IsDown()) zscan = 1;
  293.    if(scansOn->widgetChBox[3]->IsDown()) ascan = 1;
  294.  
  295.    printf("Start of Run, run case %d\n", runCase);
  296.  
  297.    float progVal;
  298.  
  299.    char ctemp[256];
  300.    char ctemp2[256];
  301.    char fname[256];
  302.    int itemp = 0;
  303.    TH1F *liveHist;
  304.  
  305.    float minVoltage, maxVoltage, stepVoltage, diffVoltage;
  306.    float minXpos, maxXpos, stepXpos, diffXpos;
  307.    float minYpos, maxYpos, stepYpos, diffYpos;
  308.    float minZpos, maxZpos, stepZpos, diffZpos;
  309.    float minAlpha, maxAlpha, stepAlpha, diffAlpha;
  310.  
  311.    minVoltage = vOutStart->widgetNE[0]->GetNumber();
  312.    maxVoltage = vOutStop->widgetNE[0]->GetNumber();
  313.    diffVoltage = abs(maxVoltage - minVoltage);
  314.    stepVoltage = abs(vOutStep->widgetNE[0]->GetNumber());
  315.    minXpos = xPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  316.    maxXpos = xPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  317.    diffXpos = abs(maxXpos - minXpos);
  318.    stepXpos = abs(xPosStep->widgetNE[0]->GetNumber());
  319.    minYpos = yPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  320.    maxYpos = yPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  321.    diffYpos = abs(maxYpos - minYpos);
  322.    stepYpos = abs(yPosStep->widgetNE[0]->GetNumber());
  323.    minZpos = zPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  324.    maxZpos = zPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  325.    diffZpos = abs(maxZpos - minZpos);
  326.    stepZpos = abs(zPosStep->widgetNE[0]->GetNumber());
  327.    minAlpha = rotPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  328.    maxAlpha = rotPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  329.    diffAlpha = abs(maxAlpha - minAlpha);
  330.    stepAlpha = abs(rotPosStep->widgetNE[0]->GetNumber());
  331.  
  332.    remove_ext((char*)fileName->widgetTE->GetText(), ctemp);
  333.  
  334.    // TODO - angle scan + voltage scan
  335.    // Voltage or surface scan
  336.    if( vscan || pscan || ascan )
  337.    {
  338.       // No Z scan, No angle scan
  339.       if(!zscan && !ascan)
  340.       {
  341.          // When we have a voltage scan
  342.          if( vscan && (stepVoltage > 0.) )
  343.             SeqNumber(runCase, (int)diffVoltage/stepVoltage, ctemp2);
  344.          // With only a surface scan
  345.          else if(pscan)
  346.          {
  347.             if( stepXpos == 0 )
  348.                itemp = 1;
  349.             else
  350.                itemp = (int)diffXpos/stepXpos;
  351.  
  352.             if( stepYpos == 0 )
  353.                itemp *= 1;
  354.             else
  355.                itemp *= (int)diffYpos/stepYpos;
  356.             SeqNumber(runCase, itemp, ctemp2);
  357.          }
  358.          sprintf(fname, "%s_%s%s", ctemp, ctemp2, histext);
  359.       }
  360.       // With Z scan, No angle scan
  361.       else if(zscan && !ascan)
  362.       {
  363.          SeqNumber((int)zPos->widgetNE[0]->GetNumber(), maxZpos, ctemp2);
  364.  
  365.          // Voltage scan is on
  366.          if( vscan && (stepVoltage > 0.) )
  367.          {
  368.             sprintf(fname, "%s_z%s_", ctemp, ctemp2);
  369.             SeqNumber(runCase, (int)diffVoltage/stepVoltage+1, ctemp2);
  370.             strcat(fname, ctemp2);
  371.             strcat(fname, histext);
  372.          }
  373.          // Surface scan is on
  374.          else if(pscan)
  375.          {
  376.             sprintf(fname, "%s_z%s_", ctemp, ctemp2);
  377.  
  378.             if( stepXpos == 0 )
  379.                itemp = 1;
  380.             else
  381.                itemp = (int)diffXpos/stepXpos+1;
  382.  
  383.             if( stepYpos == 0 )
  384.                itemp *= 1;
  385.             else
  386.                itemp *= (int)diffYpos/stepYpos+1;
  387.             SeqNumber(runCase, itemp, ctemp2);
  388.             strcat(fname, ctemp2);
  389.             strcat(fname, histext);
  390.          }
  391.          // Just Z scan
  392.          else
  393.             sprintf(fname, "%s_z%s%s", ctemp, ctemp2, histext);
  394.       }
  395.       // No Z scan, With angle scan
  396.       else if(!zscan && ascan)
  397.       {
  398.          SeqNumber(runCase, (int)diffAlpha/stepAlpha, ctemp2);
  399.  
  400.          // Voltage scan is on
  401.          if( vscan && (stepVoltage > 0.) )
  402.          {
  403.             sprintf(fname, "%s_phi%s_", ctemp, ctemp2);
  404.             SeqNumber(runCase, (int)diffVoltage/stepVoltage+1, ctemp2);
  405.             strcat(fname, ctemp2);
  406.             strcat(fname, histext);
  407.          }
  408.          // Just angle scan
  409.          else
  410.             sprintf(fname, "%s_phi%s%s", ctemp, ctemp2, histext);
  411.       }
  412.    }
  413.    // All the rest
  414.    else if(!vscan && !pscan)
  415.       sprintf(fname, "%s%s", ctemp, histext);
  416.  
  417.    // Check if set voltage is below the hard limit
  418.    if( vOut->widgetNE[0]->GetNumber() > vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() )
  419.    {
  420.       printf("Voltage hard limit triggered (%lf > %lf)!\n", vOut->widgetNE[0]->GetNumber(), vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() );
  421.       vOut->widgetNE[0]->SetNumber( vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() );
  422.    }
  423.  
  424.    printf("Output file is (runCase = %d): %s\n", runCase, fname);
  425.  
  426.    // Writing to output file
  427.    outroot = TFile::Open(fname, "RECREATE");
  428.  
  429.    TTree *header_data = new TTree("header_data", "Header information for the measurement.");
  430.    TTree *meas_data = new TTree("meas_data", "Saved ADC and TDC measurement data.");
  431.    TTree *scope_data = new TTree("scope_data", "Saved scope measurement data.");
  432.  
  433.    // Branches for the header
  434.    header_data->Branch("nrch", &evtheader.nrch, "nrch/I");
  435.    header_data->Branch("timestamp", &evtheader.timestamp, "timestamp/I");
  436.    header_data->Branch("biasvolt", &evtheader.biasvolt, "biasvolt/D");
  437.    header_data->Branch("xpos", &evtheader.xpos, "xpos/I");
  438.    header_data->Branch("ypos", &evtheader.ypos, "ypos/I");
  439.    header_data->Branch("zpos", &evtheader.zpos, "zpos/I");
  440.    header_data->Branch("temperature", &evtheader.temperature, "temperature/D");
  441.    header_data->Branch("angle", &evtheader.angle, "angle/D");
  442.    header_data->Branch("laserinfo", &evtheader.laserinfo, "laserinfo/C");
  443.  
  444.    evtheader.nrch = (int)NCH->widgetNE[0]->GetNumber()*2;
  445.    evtheader.timestamp = (int)time(NULL);
  446.    evtheader.biasvolt = (double)vOut->widgetNE[0]->GetNumber();
  447.    if(posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  448.    {
  449.       evtheader.xpos = (int)xPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  450.       evtheader.ypos = (int)yPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  451.       evtheader.zpos = (int)zPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  452.    }
  453.    else if(posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  454.    {
  455.       evtheader.xpos = (int)xPos->widgetNE[0]->GetNumber()/lenconversion;
  456.       evtheader.ypos = (int)yPos->widgetNE[0]->GetNumber()/lenconversion;
  457.       evtheader.zpos = (int)zPos->widgetNE[0]->GetNumber()/lenconversion;
  458.    }
  459.    evtheader.temperature = (double)chtemp->widgetNE[0]->GetNumber();
  460.    if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  461.       evtheader.angle = (double)rotPos->widgetNE[0]->GetNumber()*rotconversion;
  462.    else if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  463.       evtheader.angle = (double)rotPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  464.    sprintf(evtheader.laserinfo, "%s", laserInfo->widgetTE->GetText());
  465.  
  466.    char histtime[256];
  467.    GetTime(evtheader.timestamp, histtime);
  468.  
  469.    printf("Save file header information:\n");
  470.    printf("- Number of channels: %d\n", evtheader.nrch);
  471.    printf("- Timestamp: %d (%s)\n", evtheader.timestamp, histtime);
  472.    printf("- Bias voltage: %lf\n", evtheader.biasvolt);
  473.    printf("- Table position (X,Y,Z): %d, %d, %d\n", evtheader.xpos, evtheader.ypos, evtheader.zpos);
  474.    printf("- Temperature: %lf\n", evtheader.temperature);
  475.    printf("- Incidence angle: %lf\n", evtheader.angle);
  476.    printf("- Laser and filter settings: %s\n", evtheader.laserinfo);
  477.  
  478.    header_data->Fill();
  479.  
  480.    // Branches for ADC and TDC data
  481.    for(int i = 0; i < evtheader.nrch/2; i++)
  482.    {
  483.       sprintf(ctemp, "ADC%d", i);
  484.       sprintf(fname, "ADC%d/I", i);
  485.       meas_data->Branch(ctemp, &evtdata.adcdata[i], fname);
  486.  
  487.       sprintf(ctemp, "TDC%d", i);
  488.       sprintf(fname, "TDC%d/I", i);
  489.       meas_data->Branch(ctemp, &evtdata.tdcdata[i], fname);
  490.    }
  491.  
  492.    //TODO
  493.    // Initialize the scope before measurement
  494. /*   if( sCamaclink->IsDown() )
  495.       InitializeScope();*/
  496.  
  497.    // Branch for scope measurement data
  498. /*   if(gScopeDaq->scopeUseType == 2) // only if we select waveform measurement
  499.    {
  500.       if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 0)
  501.          scope_data->Branch("amp", &evtmeas.measdata, "amp/D");
  502.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 1)
  503.          scope_data->Branch("area", &evtmeas.measdata, "area/D");
  504.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 2)
  505.          scope_data->Branch("delay", &evtmeas.measdata, "delay/D");
  506.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 3)
  507.          scope_data->Branch("fall", &evtmeas.measdata, "fall/D");
  508.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 4)
  509.          scope_data->Branch("freq", &evtmeas.measdata, "freq/D");
  510.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 5)
  511.          scope_data->Branch("max", &evtmeas.measdata, "max/D");
  512.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 6)
  513.          scope_data->Branch("mean", &evtmeas.measdata, "mean/D");
  514.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 7)
  515.          scope_data->Branch("min", &evtmeas.measdata, "min/D");
  516.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 8)
  517.          scope_data->Branch("pk2p", &evtmeas.measdata, "pk2p/D");
  518.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 9)
  519.          scope_data->Branch("pwidth", &evtmeas.measdata, "pwidth/D");
  520.       else if(gScopeDaq->scopeMeasSel == 10)
  521.          scope_data->Branch("rise", &evtmeas.measdata, "rise/D");
  522.    }*/
  523.  
  524.    int neve  = (int) evtNum->widgetNE[0]->GetNumber();
  525.    int allEvt, zProg;
  526.    zProg = 1;
  527.  
  528. #if WORKSTAT == 'I'
  529. #else
  530. // ONLY FOR TESTING!
  531.    TRandom *randNum = new TRandom();
  532.    randNum->SetSeed(0);
  533. // ONLY FOR TESTING!
  534. #endif
  535.  
  536.    // Initialize the CAMAC
  537.    if (gDaq)
  538.    {
  539.       if(scanon == 0)
  540.       {
  541.          gDaq->init(evtheader.nrch);
  542.          scanon = 1;
  543.       }
  544.       gDaq->fStop=0;
  545.  
  546.       // Set the stopwatch
  547.       clock_t clkt1;
  548.  
  549.       // Prepare histogram for live histogram update
  550.       int liven;
  551.       TCanvas *gCanvas;
  552.       if(liveUpdate && (!vscan && !pscan && !zscan && !ascan))
  553.       {
  554.          gCanvas = measCanvas->GetCanvas();
  555.          gCanvas->SetGrid();
  556.          gCanvas->cd();
  557.          liveHist = new TH1F(histname,"",(int)TMath::Sqrt(neve),0,0);
  558.          liven = 1;
  559.       }
  560.  
  561.       // Start gathering
  562.       gDaq->start();
  563.  
  564.       for (int n=0;n<neve && !gDaq->fStop ;/*n++*/)
  565.       {
  566.          int nb = gDaq->event(gBuf,BSIZE);
  567.  
  568. #if WORKSTAT == 'I'
  569. #else
  570. // ONLY FOR TESTING!
  571.          for(int i=0; i < evtheader.nrch; i++)
  572.          {
  573.             if(i == 1)
  574.                gBuf[i] = randNum->Gaus(1500,300);
  575.             else if(i == 0)
  576.                gBuf[i] = randNum->Poisson(2500);
  577.          }
  578. // ONLY FOR TESTING!
  579. #endif
  580.          if (nb<=0) n--;
  581.  
  582.          int nc=0;
  583.  
  584.          while ( (nb>0) && (n<neve) )
  585.          {
  586.             for(int i = 0; i < evtheader.nrch; i++)
  587.             {
  588.                unsigned short adc = gBuf[i+nc]&0xFFFF;
  589.                if(i % 2 == 0)           // TDC
  590.                   evtdata.tdcdata[i/2] = (int)adc;
  591.                else if(i % 2 == 1)      // ADC
  592.                   evtdata.adcdata[i/2] = (int)adc;
  593.  
  594.                // Start plotting the scope waveform
  595. /*             if( (gScopeDaq->scopeUseType == 1) && (sCamaclink->IsDown()) )
  596.                   StartScopeAcq();*/ // TODO
  597.             }
  598.             meas_data->Fill();
  599.             n++;
  600. sleep(1);
  601.  
  602.             // Start making a scope measurement
  603. /*          if( (gScopeDaq->scopeUseType == 2) && (sCamaclink->IsDown()) )
  604.             {
  605.                StartScopeAcq();
  606.                evtmeas.measdata = gScopeDaq->measubuf;
  607.             }
  608.             scope_data->Fill();*/ // TODO
  609.  
  610.             // Start filling the histogram (only in normal single scan)
  611.             if(liveUpdate && (!vscan && !pscan && !zscan && !ascan))
  612.             {
  613.                liveHist->Fill(evtdata.adcdata[0]);
  614.                if( n == (neve*liven)/10 )
  615.                {
  616.                   gCanvas->cd();
  617.                   liveHist->Draw("");
  618.                   gCanvas->Modified();
  619.                   gCanvas->Update();
  620.                   liven++;
  621.                }
  622.             }
  623.            
  624.             nc += evtheader.nrch;
  625.             nb -= evtheader.nrch;
  626.          }
  627.  
  628.          MyTimer();
  629.          allEvt = n;
  630.          if (gSystem->ProcessEvents()) printf("Run Interrupted\n");
  631.  
  632.          if( acqStarted && (n == (neve*zProg)/10) && (!vscan && !pscan && !zscan && !ascan) )
  633.          {
  634.             // Progress the progress bar
  635.             progVal = (float)zProg*10;
  636.             measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  637.  
  638.             // Calculate the remaining time
  639.             TimeEstimate(clkt0, timet0, progVal, ctemp, 0);
  640.             printf("End time: %s\n", ctemp);
  641.             measProgress->widgetTE->SetText(ctemp);
  642.  
  643.             gVirtualX->Update(1);
  644.             zProg++;
  645.          }
  646.       }
  647.  
  648.       printf("Number of gathered events: %d\n", allEvt);
  649.       measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  650.       acqStarted = false;
  651.  
  652.       gDaq->stop();
  653.    }
  654.  
  655.    printf("End of Run neve=%d\n",neve);
  656.  
  657.    header_data->Write();
  658.    meas_data->Write();
  659. //   scope_data->Write(); // TODO
  660.    delete header_data;
  661.    delete meas_data;
  662.    delete scope_data;
  663.  
  664.    // Remove the histogram
  665.    if(liveUpdate && (!vscan && !pscan && !zscan && !ascan))
  666.       delete liveHist;
  667.  
  668.  
  669.    outroot->Close();
  670. }
  671.  
  672. int TGAppMainFrame::MyTimer()
  673. {
  674.    char cmd[100];
  675.    GetTime(-1, cmd);
  676.    if (timeStamp) timeStamp->widgetTE->SetText(cmd);
  677.    return 0;
  678. }
  679.  
  680. // Additional functions -------------------------------------
  681.  
  682. // Settings pane connections --------------------------------
  683.  
  684. // Enable or disable scans
  685. void TGAppMainFrame::EnableScan(int type)
  686. {
  687.    // Voltage scan
  688.    if(type == 0)
  689.    {
  690.       if(scansOn->widgetChBox[type]->IsOn())
  691.       {
  692.          vOutStart->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  693.          vOutStop->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  694.          vOutStep->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  695.       }
  696.       else
  697.       {
  698.          vOutStart->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  699.          vOutStop->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  700.          vOutStep->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  701.       }
  702.    }
  703.    // Surface (X, Y axis) scan
  704.    else if(type == 1)
  705.    {
  706.       if(scansOn->widgetChBox[type]->IsOn())
  707.       {
  708.          xPosMin->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  709.          xPosMax->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  710.          xPosStep->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  711.          yPosMin->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  712.          yPosMax->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  713.          yPosStep->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  714.       }
  715.       else
  716.       {
  717.          xPosMin->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  718.          xPosMax->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  719.          xPosStep->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  720.          yPosMin->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  721.          yPosMax->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  722.          yPosStep->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  723.       }
  724.    }
  725.    // Z axis scan
  726.    else if(type == 2)
  727.    {
  728.       if(scansOn->widgetChBox[type]->IsOn())
  729.       {
  730.          zPosMin->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  731.          zPosMax->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  732.          zPosStep->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  733.       }
  734.       else
  735.       {
  736.          zPosMin->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  737.          zPosMax->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  738.          zPosStep->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  739.       }
  740.    }
  741.    // Incidence angle scan
  742.    else if(type == 3)
  743.    {
  744.       if(scansOn->widgetChBox[type]->IsOn())
  745.       {
  746.          rotPosMin->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  747.          rotPosMax->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  748.          rotPosStep->widgetNE[0]->SetState(kTRUE);
  749.       }
  750.       else
  751.       {
  752.          rotPosMin->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  753.          rotPosMax->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  754.          rotPosStep->widgetNE[0]->SetState(kFALSE);
  755.       }
  756.    }
  757. }
  758.  
  759. // Apply the upper voltage limit from settings pane to main window
  760. void TGAppMainFrame::VoltageLimit()
  761. {
  762.    vOut->widgetNE[0]->SetLimitValues(0, vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() );
  763. }
  764.  
  765. // Select the table position units to be used (1 = 0.3595 micron)
  766. void TGAppMainFrame::ChangeUnits(int type)
  767. {
  768.    int pos[12], poslim[3], chng = 0;
  769.    double micro[12], microlim[3];
  770.  
  771.    TGNumberEntry *posEntries[12];
  772.    posEntries[0] = (TGNumberEntry*)xPos->widgetNE[0];
  773.    posEntries[1] = (TGNumberEntry*)yPos->widgetNE[0];
  774.    posEntries[2] = (TGNumberEntry*)zPos->widgetNE[0];
  775.    posEntries[3] = (TGNumberEntry*)xPosMin->widgetNE[0];
  776.    posEntries[4] = (TGNumberEntry*)xPosMax->widgetNE[0];
  777.    posEntries[5] = (TGNumberEntry*)xPosStep->widgetNE[0];
  778.    posEntries[6] = (TGNumberEntry*)yPosMin->widgetNE[0];
  779.    posEntries[7] = (TGNumberEntry*)yPosMax->widgetNE[0];
  780.    posEntries[8] = (TGNumberEntry*)yPosStep->widgetNE[0];
  781.    posEntries[9] = (TGNumberEntry*)zPosMin->widgetNE[0];
  782.    posEntries[10] = (TGNumberEntry*)zPosMax->widgetNE[0];
  783.    posEntries[11] = (TGNumberEntry*)zPosStep->widgetNE[0];
  784.  
  785.    // Table position values
  786.    if(type == 0)
  787.    {
  788.       // Check if we had microns before
  789.       if(posEntries[0]->GetNumStyle() == TGNumberFormat::kNESRealTwo)
  790.          chng = 1;
  791.  
  792.       // Change to table position values  
  793.       if(chng == 1)
  794.       {
  795.          for(int i = 0; i < 12; i++)
  796.          {
  797.             if(posEntries[i]->GetNumber() == 0.0)
  798.                pos[i] = 0;
  799.             else
  800.                pos[i] = (int)posEntries[i]->GetNumber()/lenconversion;
  801.          }
  802.  
  803.          poslim[0] = -100;
  804.          poslim[1] = 215000;
  805.          poslim[2] = 375000;
  806.  
  807.          for(int i = 0; i < 12; i++)
  808.          {
  809.             posEntries[i]->SetNumStyle(TGNumberFormat::kNESInteger);
  810.             if( (i > 8) || (i == 2) ) // limits for Z axis (longer table)
  811.                posEntries[i]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, poslim[0], poslim[2]);
  812.             else
  813.                posEntries[i]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, poslim[0], poslim[1]);
  814.  
  815.             posEntries[i]->SetNumber(pos[i]);
  816.          }
  817.       }
  818.    }
  819.    // Microns
  820.    else if(type == 1)
  821.    {
  822.       // Check if we had table position values before
  823.       if(posEntries[0]->GetNumStyle() == TGNumberFormat::kNESInteger)
  824.          chng = 1;
  825.  
  826.       // Change to microns  
  827.       if(chng == 1)
  828.       {
  829.          for(int i = 0; i < 12; i++)
  830.          {
  831.             if(posEntries[i]->GetNumber() == 0.0)
  832.                micro[i] = 0.;
  833.             else
  834.                micro[i] = (double)posEntries[i]->GetNumber()*lenconversion;
  835.          }
  836.    
  837.          microlim[0] = (double)-100*lenconversion;
  838.          microlim[1] = (double)215000*lenconversion;
  839.          microlim[2] = (double)375000*lenconversion;
  840.    
  841.          for(int i = 0; i < 12; i++)
  842.          {
  843.             posEntries[i]->SetNumStyle(TGNumberFormat::kNESRealTwo);
  844.             if( (i > 8) || (i == 2) ) // limits for Z axis (longer table)
  845.                posEntries[i]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, microlim[0], microlim[2]);
  846.             else
  847.                posEntries[i]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, microlim[0], microlim[1]);
  848.    
  849.             posEntries[i]->SetNumber(micro[i]);
  850.          }
  851.       }
  852.    }
  853. }
  854.  
  855. // Select the rotation units to be used (1 = 6.3281/3600 degrees)
  856. void TGAppMainFrame::ChangeUnitsRot(int type)
  857. {
  858.    int rot[4], rotlim[2], chng = 0;
  859.    double deg[4], deglim[2];
  860.  
  861.    TGNumberEntry *rotEntries[4];
  862.    rotEntries[0] = (TGNumberEntry*)rotPos->widgetNE[0];
  863.    rotEntries[1] = (TGNumberEntry*)rotPosMin->widgetNE[0];
  864.    rotEntries[2] = (TGNumberEntry*)rotPosMax->widgetNE[0];
  865.    rotEntries[3] = (TGNumberEntry*)rotPosStep->widgetNE[0];
  866.  
  867.    // Rotation values
  868.    if(type == 0)
  869.    {
  870.       // Check if we had degrees before
  871.       if(rotEntries[0]->GetNumStyle() == TGNumberFormat::kNESRealTwo)
  872.          chng = 1;
  873.  
  874.       // Change to rotation values  
  875.       if(chng == 1)
  876.       {
  877.          for(int i = 0; i < 4; i++)
  878.          {
  879.             if(rotEntries[i]->GetNumber() == 0.0)
  880.                rot[i] = 0;
  881.             else
  882.                rot[i] = (int)rotEntries[i]->GetNumber()/rotconversion;
  883.          }
  884.  
  885.          rotlim[0] = (int)-180/rotconversion;
  886.          rotlim[1] = (int)180/rotconversion;
  887.  
  888.          for(int i = 0; i < 4; i++)
  889.          {
  890.             rotEntries[i]->SetNumStyle(TGNumberFormat::kNESInteger);
  891.             rotEntries[i]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, rotlim[0], rotlim[1]);
  892.  
  893.             rotEntries[i]->SetNumber(rot[i]);
  894.          }
  895.       }
  896.    }
  897.    // Degree
  898.    else if(type == 1)
  899.    {
  900.       // Check if we had table position values before
  901.       if(rotEntries[0]->GetNumStyle() == TGNumberFormat::kNESInteger)
  902.          chng = 1;
  903.  
  904.       // Change to degrees  
  905.       if(chng == 1)
  906.       {
  907.          for(int i = 0; i < 4; i++)
  908.          {
  909.             if(rotEntries[i]->GetNumber() == 0)
  910.                deg[i] = 0.;
  911.             else
  912.                deg[i] = (double)rotEntries[i]->GetNumber()*rotconversion;
  913.          }
  914.    
  915.          deglim[0] = -180.;
  916.          deglim[1] = 180.;
  917.    
  918.          for(int i = 0; i < 4; i++)
  919.          {
  920.             rotEntries[i]->SetNumStyle(TGNumberFormat::kNESRealTwo);
  921.             rotEntries[i]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, deglim[0], deglim[1]);
  922.    
  923.             rotEntries[i]->SetNumber(deg[i]);
  924.          }
  925.       }
  926.    }
  927. }
  928.  
  929. // Enable display canvas to have a live update of histogram
  930. void TGAppMainFrame::EnableLiveUpdate()
  931. {
  932.    liveUpdate = liveDisp->widgetChBox[0]->IsDown();
  933. }
  934.  
  935. // Settings pane connections --------------------------------
  936.  
  937. // Main measurement window connections ----------------------
  938.  
  939. // Get the currently selected channel
  940. int TGAppMainFrame::GetChannel()
  941. {
  942.    int selectedOutput;
  943.    if(vOutCh->widgetCB->GetSelected() < 8) selectedOutput = (vOutCh->widgetCB->GetSelected())+1;
  944.    else if( (vOutCh->widgetCB->GetSelected() >= 8) && (vOutCh->widgetCB->GetSelected() < 16) ) selectedOutput = (vOutCh->widgetCB->GetSelected())+93;
  945.    else selectedOutput = 1;
  946.  
  947.    return selectedOutput;
  948. }
  949.  
  950. // Set, get or reset the output voltage
  951. void TGAppMainFrame::VoltOut(int opt)
  952. {
  953.    char cmd[256];
  954.  
  955.    // Set the selected voltage
  956.    if(opt == 0)
  957.    {
  958.       int outOn;
  959.       float outputVoltage;
  960.      
  961.       outputVoltage = vOut->widgetNE[0]->GetNumber();
  962.    
  963.       if(vOutOpt->widgetChBox[1]->IsOn()) outOn = 1;
  964.       else outOn = 0;
  965.      
  966.       fflush(stdout);
  967.       sprintf(cmd, "%s/src/mpod/mpod_voltage.sh -o %d -v %f -s %d", rootdir, GetChannel(), outputVoltage, outOn);
  968. #if WORKSTAT == 'I'
  969.       retTemp = system(cmd);
  970. #else
  971.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  972. #endif
  973.       fflush(stdout);
  974.    }
  975.    // Get current voltage
  976.    else if(opt == 1)
  977.    {
  978.       fflush(stdout);
  979.       sprintf(cmd, "%s/src/mpod/mpod_voltage.sh -o %d -g > %s/settings/curvolt.txt", rootdir, GetChannel(), rootdir);
  980. #if WORKSTAT == 'I'
  981.       retTemp = system(cmd);
  982. #else
  983.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  984. #endif
  985.       fflush(stdout);
  986.  
  987. #if WORKSTAT == 'I'
  988.       FILE* fvolt;
  989.       double dtemp;
  990.       char ctemp[24];
  991.       sprintf(cmd, "%s/settings/curvolt.txt", rootdir);
  992.       fvolt = fopen(cmd, "r");
  993.      
  994.       if(fvolt != NULL)
  995.       {
  996.          sprintf(cmd, "WIENER-CRATE-MIB::outputVoltage.u%d = Opaque: Float: %s V\n", GetChannel()-1, "%lf" );
  997.          retTemp = fscanf(fvolt, cmd, &dtemp);
  998.          vOut->widgetNE[0]->SetNumber(dtemp);
  999.          sprintf(cmd, "WIENER-CRATE-MIB::outputSwitch.u%d = INTEGER: %s\n", GetChannel()-1, "%s" );
  1000.          retTemp = fscanf(fvolt, cmd, ctemp);
  1001.          if( strcmp(ctemp, "On(1)") == 0 )
  1002.             vOutOpt->widgetChBox[1]->SetState(kButtonDown);
  1003.          else if( strcmp(ctemp, "Off(0)") == 0 )
  1004.             vOutOpt->widgetChBox[1]->SetState(kButtonUp);
  1005.       }
  1006.    
  1007.       fclose(fvolt);
  1008. #endif
  1009.    }
  1010.    // Reset output voltage (if stuck in interlock)
  1011.    else if(opt == 2)
  1012.    {
  1013.       vOut->widgetNE[0]->SetNumber(0.000);
  1014.       vOutOpt->widgetChBox[1]->SetState(kButtonUp);
  1015.  
  1016.       fflush(stdout);
  1017.       sprintf(cmd, "%s/src/mpod/mpod_voltage.sh -r %d", rootdir, GetChannel());
  1018. #if WORKSTAT == 'I'
  1019.       retTemp = system(cmd);
  1020. #else
  1021.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1022. #endif
  1023.       fflush(stdout);
  1024.    }
  1025. }
  1026.  
  1027. // Set output voltage polarity to negative
  1028. void TGAppMainFrame::NegativePolarity()
  1029. {
  1030.    double newHardlimit;
  1031.    int polar = 0;  // 0 = positive, 1 = negative
  1032.  
  1033.    if(vOutOpt->widgetChBox[0]->IsOn())
  1034.       polar = 1;
  1035.    else
  1036.       polar = 0;
  1037.  
  1038.    // Set hard limit to the negative version of what it was before
  1039.    if( (vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() > 0.) && (polar == 1) )
  1040.       newHardlimit = -(vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber());
  1041.    else if( (vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() < 0.) && (polar == 0) )
  1042.       newHardlimit = -(vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber());
  1043.    else if(vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber() == 0.)
  1044.       newHardlimit = 0.;
  1045.    else
  1046.       newHardlimit = vHardlimit->widgetNE[0]->GetNumber();
  1047.  
  1048.    // Apropriately set the limit to the output voltage number entry
  1049.    vHardlimit->widgetNE[0]->SetNumber(newHardlimit);
  1050.  
  1051.    if(polar == 1)
  1052.       vOut->widgetNE[0]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, newHardlimit, 0.);
  1053.    else if(polar == 0)
  1054.       vOut->widgetNE[0]->SetLimits(TGNumberFormat::kNELLimitMinMax, 0., newHardlimit);
  1055. }
  1056.  
  1057. // Set, get, home or reset the table position
  1058. void TGAppMainFrame::PositionSet(int opt)
  1059. {
  1060.    char cmd[1024];
  1061.  
  1062.    // Set the selected table position
  1063.    if(opt == 0)
  1064.    {
  1065.       int positX, positY, positZ;
  1066.  
  1067.       if(posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1068.       {
  1069.          positX = xPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  1070.          positY = yPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  1071.          positZ = zPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  1072.       }
  1073.       else if(posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1074.       {
  1075.          positX = (int)xPos->widgetNE[0]->GetNumber()/lenconversion;
  1076.          positY = (int)yPos->widgetNE[0]->GetNumber()/lenconversion;
  1077.          positZ = (int)zPos->widgetNE[0]->GetNumber()/lenconversion;
  1078.       }
  1079.  
  1080.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -c m", rootdir, positX, rootdir);
  1081. #if WORKSTAT == 'I'
  1082.       retTemp = system(cmd);
  1083. #else
  1084.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1085. #endif
  1086.  
  1087.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -c m", rootdir, positY, rootdir);
  1088. #if WORKSTAT == 'I'
  1089.       retTemp = system(cmd);
  1090. #else
  1091.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1092. #endif
  1093.  
  1094.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -c m", rootdir, positZ, rootdir);
  1095. #if WORKSTAT == 'I'
  1096.       retTemp = system(cmd);
  1097. #else
  1098.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1099. #endif
  1100.    }
  1101.    // Get current table position
  1102.    else if(opt == 1)
  1103.    {
  1104.       fflush(stdout);
  1105.    
  1106.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -p > %s/settings/curpos.txt", rootdir, rootdir);  // X-axis
  1107.       fflush(stdout);
  1108. #if WORKSTAT == 'I'
  1109.       retTemp = system(cmd);
  1110. #else
  1111.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1112. #endif
  1113.    
  1114.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -p >> %s/settings/curpos.txt", rootdir, rootdir); // Y-axis
  1115.       fflush(stdout);
  1116. #if WORKSTAT == 'I'
  1117.       retTemp = system(cmd);
  1118. #else
  1119.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1120. #endif
  1121.    
  1122.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -p >> %s/settings/curpos.txt", rootdir, rootdir); // Z-axis
  1123.       fflush(stdout);
  1124. #if WORKSTAT == 'I'
  1125.       retTemp = system(cmd);
  1126. #else
  1127.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1128. #endif
  1129.  
  1130. #if WORKSTAT == 'I'
  1131.       FILE* fpos;
  1132.       int itemp;
  1133.       sprintf(cmd, "%s/settings/curpos.txt", rootdir);
  1134.       fpos = fopen(cmd, "r");
  1135.      
  1136.       if(fpos != NULL)
  1137.       {
  1138.          if(posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1139.          {
  1140.             retTemp = fscanf(fpos, "%d\n", &itemp);
  1141.             xPos->widgetNE[0]->SetNumber(itemp);
  1142.             retTemp = fscanf(fpos, "%d\n", &itemp);
  1143.             yPos->widgetNE[0]->SetNumber(itemp);
  1144.             retTemp = fscanf(fpos, "%d\n", &itemp);
  1145.             zPos->widgetNE[0]->SetNumber(itemp);
  1146.          }
  1147.          else if(posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1148.          {
  1149.             retTemp = fscanf(fpos, "%d\n", &itemp);
  1150.             xPos->widgetNE[0]->SetNumber((double)itemp*lenconversion);
  1151.             retTemp = fscanf(fpos, "%d\n", &itemp);
  1152.             yPos->widgetNE[0]->SetNumber((double)itemp*lenconversion);
  1153.             retTemp = fscanf(fpos, "%d\n", &itemp);
  1154.             zPos->widgetNE[0]->SetNumber((double)itemp*lenconversion);
  1155.          }
  1156.       }
  1157.  
  1158.       fclose(fpos);
  1159. #endif
  1160.    }
  1161.    // Home the table position
  1162.    else if(opt == 2)
  1163.    {
  1164.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -h", rootdir);    // X-axis
  1165. #if WORKSTAT == 'I'
  1166.       retTemp = system(cmd);
  1167. #else
  1168.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1169. #endif
  1170.  
  1171.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -h", rootdir);    // Y-axis
  1172. #if WORKSTAT == 'I'
  1173.       retTemp = system(cmd);
  1174. #else
  1175.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1176. #endif
  1177.  
  1178.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -h", rootdir);    // Z-axis
  1179. #if WORKSTAT == 'I'
  1180.       retTemp = system(cmd);
  1181. #else
  1182.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1183. #endif
  1184.       PositionSet(1);
  1185.    }
  1186.    // Reset the table position
  1187.    else if(opt == 3)
  1188.    {
  1189.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -r && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -i 3 && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -h", rootdir, rootdir, rootdir);        // X-axis
  1190. #if WORKSTAT == 'I'
  1191.       printf("Positioning table reset, initialization and homing in progress. Please wait...\n");
  1192.       retTemp = system(cmd);
  1193. #else
  1194.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1195. #endif
  1196.  
  1197.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -r && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -i 3 && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -h", rootdir, rootdir, rootdir);        // Y-axis
  1198. #if WORKSTAT == 'I'
  1199.       retTemp = system(cmd);
  1200. #else
  1201.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1202. #endif
  1203.  
  1204.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -r && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -i 3 && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -h", rootdir, rootdir, rootdir);        // Z-axis
  1205. #if WORKSTAT == 'I'
  1206.       retTemp = system(cmd);
  1207.       printf("Positioning table reset, initialization and homing complete.\n");
  1208. #else
  1209.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1210. #endif
  1211.       PositionSet(1);
  1212.    }
  1213. }
  1214.  
  1215. // Set, get, home or reset the rotation platform
  1216. void TGAppMainFrame::RotationSet(int opt)
  1217. {
  1218.    char cmd[1024];
  1219.  
  1220.    // Set the selected rotation
  1221.    if(opt == 0)
  1222.    {
  1223.       int positAlpha;
  1224.  
  1225.       if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1226.          positAlpha = rotPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  1227.       else if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1228.          positAlpha = rotPos->widgetNE[0]->GetNumber()/rotconversion;
  1229.  
  1230.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -c m", rootdir, positAlpha, rootdir);
  1231. #if WORKSTAT == 'I'
  1232.       retTemp = system(cmd);
  1233. #else
  1234.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1235. #endif
  1236.    }
  1237.    // Get current rotation
  1238.    else if(opt == 1)
  1239.    {
  1240.       fflush(stdout);
  1241.    
  1242.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -p > %s/settings/currot.txt", rootdir, rootdir);
  1243.       fflush(stdout);
  1244. #if WORKSTAT == 'I'
  1245.       retTemp = system(cmd);
  1246. #else
  1247.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1248. #endif
  1249.  
  1250. #if WORKSTAT == 'I'
  1251.       FILE* frot;
  1252.       int itemp;
  1253.       sprintf(cmd, "%s/settings/currot.txt", rootdir);
  1254.       frot = fopen(cmd, "r");
  1255.  
  1256.       if(frot != NULL)
  1257.       {
  1258.          retTemp = fscanf(frot, "%d\n", &itemp);
  1259.          if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1260.             rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(itemp);
  1261.          else if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1262.             rotPos->widgetNE[0]->SetNumber((double)itemp*rotconversion);
  1263.       }
  1264.  
  1265.       fclose(frot);
  1266. #endif
  1267.    }
  1268.    // Home the rotation
  1269.    else if(opt == 2)
  1270.    {
  1271.       // TODO: For now only set back to 0, not home!
  1272. //      sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -h", rootdir);
  1273.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -v 0 -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -c m", rootdir, rootdir);
  1274. #if WORKSTAT == 'I'
  1275.       retTemp = system(cmd);
  1276. #else
  1277.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1278. #endif
  1279.       RotationSet(1);
  1280.    }
  1281.    // Reset the rotation
  1282.    else if(opt == 3)
  1283.    {
  1284.       // TODO: For now only set back to 0, not home!
  1285.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -r && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -i 2 && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -h", rootdir, rootdir, rootdir);
  1286. #if WORKSTAT == 'I'
  1287.       printf("Rotation platform reset, initalization and homing in progress. Please wait...\n");
  1288.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -v 0 -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -c m", rootdir, rootdir);
  1289.       retTemp = system(cmd);
  1290.       sleep(15);        // wait for the motor to change position from wherever to 0
  1291.       sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -r && sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -i 2", rootdir, rootdir);
  1292.       retTemp = system(cmd);
  1293.       printf("Rotation platform reset, initalization and homing complete.\n");
  1294. #else
  1295.       printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1296. #endif
  1297.       RotationSet(1);
  1298.    }
  1299. }
  1300.  
  1301. // File browser for selecting the save file
  1302. void TGAppMainFrame::SaveFile()
  1303. {
  1304.    TGFileInfo file_info;
  1305.    const char *filetypes[] = {"Histograms",histextall,0,0};
  1306.    char *cTemp;
  1307.    file_info.fFileTypes = filetypes;
  1308.    cTemp = new char[1024];
  1309.    sprintf(cTemp, "%s/results", rootdir);
  1310.    file_info.fIniDir = StrDup(cTemp);
  1311.    new TGFileDialog(gClient->GetDefaultRoot(), fMain, kFDSave, &file_info);
  1312.    delete[] cTemp;
  1313.  
  1314.    if(file_info.fFilename != NULL)
  1315.       fileName->widgetTE->SetText(file_info.fFilename);
  1316. }
  1317.  
  1318. // Start the acquisition
  1319. void TGAppMainFrame::StartAcq()
  1320. {
  1321.    // Variable that will initialize camac only once (for scans)
  1322.    int scanon = 0;
  1323.  
  1324.    // Determine the type of measurement to perform
  1325.    int vscan = 0, pscan = 0, zscan = 0, ascan = 0;
  1326.    if(scansOn->widgetChBox[0]->IsDown()) vscan = 1;
  1327.    if(scansOn->widgetChBox[1]->IsDown()) pscan = 1;
  1328.    if(scansOn->widgetChBox[2]->IsDown()) zscan = 1;
  1329.    if(scansOn->widgetChBox[3]->IsDown()) ascan = 1;
  1330.  
  1331.    char cmd[256];
  1332.    int i, j, k;
  1333.    float progVal;
  1334.    FILE *pfin;
  1335.  
  1336.    // Variables for voltage scan
  1337.    float currentVoltage, minVoltage, maxVoltage, stepVoltage;
  1338.    int repetition;
  1339.  
  1340.    // Variables for surface scan and Z axis scan
  1341.    float minXpos, maxXpos, stepXpos;
  1342.    float minYpos, maxYpos, stepYpos;
  1343.    float minZpos, maxZpos, stepZpos;
  1344.    int repetX, repetY, repetZ;
  1345.  
  1346.    // Variables for angle scan
  1347.    float currentAlpha, minAlpha, maxAlpha, stepAlpha;
  1348.    int repetAlpha;
  1349.  
  1350.    // Only voltage scan
  1351.    if( (vscan == 1) && (pscan == 0) && (ascan == 0) )
  1352.    { // TODO - include possibility to make voltage and angle scan at same time
  1353.       // If already started, stop the acquisition
  1354.       if(acqStarted)
  1355.       {
  1356.          printf("Stopping current voltage scan...\n");
  1357.          gROOT->SetInterrupt();
  1358.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1359.          acqStarted = false;
  1360.  
  1361.          // Write information to the finish_sig.txt value
  1362.          sprintf(cmd, "%s/dbg/finish_sig.txt", rootdir);
  1363.          pfin = fopen(cmd,"w");
  1364.          fprintf(pfin, "%s: Voltage scan stopped.", timeStamp->widgetTE->GetText());
  1365.          fclose(pfin);
  1366.       }
  1367.       // If stopped, start the acquisition
  1368.       else if(!acqStarted)
  1369.       {
  1370.          printf("Running a voltage scan...\n");
  1371.  
  1372.          // Check the steps
  1373.          minVoltage = vOutStart->widgetNE[0]->GetNumber();
  1374.          maxVoltage = vOutStop->widgetNE[0]->GetNumber();
  1375.          stepVoltage = vOutStep->widgetNE[0]->GetNumber();
  1376.  
  1377.          if(stepVoltage == 0.)
  1378.             repetition = 1;
  1379.          else
  1380.          {
  1381.             // Example: min = 40, max = 70, step = 5 (in increasing steps)
  1382.             if( (maxVoltage > minVoltage) && (stepVoltage > 0) )
  1383.                repetition = ((maxVoltage - minVoltage)/stepVoltage)+1;
  1384.             // Example: min = 70, max = 40, step = -5 (in decreasing steps)
  1385.             else if( (maxVoltage < minVoltage) && (stepVoltage < 0) )
  1386.                repetition = ((minVoltage - maxVoltage)/stepVoltage)-1;
  1387.             // Example: min = 70, max = 70 (no scan)
  1388.             else if( maxVoltage == minVoltage )
  1389.                repetition = 1;
  1390.             // If step is not correctly set, stop the acqusition
  1391.             else
  1392.             {
  1393.                // TODO
  1394.                printf("Stopping current voltage scan...\n");
  1395.                gROOT->SetInterrupt();
  1396.                measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1397.                acqStarted = false;
  1398.                repetition = 0;
  1399.             }
  1400.          }
  1401.  
  1402.          if(DBGSIG) printf("StartAcq(): Voltage repetition (%lf,%lf,%lf) = %d\n", minVoltage, maxVoltage, stepVoltage, repetition);
  1403.  
  1404.          i = 0;
  1405.  
  1406.          // TODO - Setting button text and acqStarted do not work!
  1407.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Stop acquisition");
  1408.          acqStarted = true;
  1409.          progVal = 0.00;
  1410.          measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1411.          gVirtualX->Update(1);
  1412.  
  1413.          clkt0 = clock();
  1414.          timet0 = time(NULL);
  1415.  
  1416.          while(1)
  1417.          {
  1418.             if( (repetition > 0) && (i == repetition) ) break;
  1419.             else if( (repetition < 0) && (i == -repetition) ) break;
  1420.             else if( repetition == 0 ) break;
  1421.  
  1422.             progVal = (float)(100.00/abs(repetition))*i;
  1423.             measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1424.  
  1425.             TimeEstimate(clkt0, timet0, progVal, cmd, singlewait*abs(repetition));
  1426.             measProgress->widgetTE->SetText(cmd);
  1427.  
  1428.             gVirtualX->Update(1);
  1429.        
  1430.             fflush(stdout);
  1431.             currentVoltage = minVoltage + stepVoltage*i;
  1432.             sprintf(cmd, "%s/src/mpod/mpod_voltage.sh -o %d -v %f -s 1", rootdir, GetChannel(), currentVoltage);
  1433. #if WORKSTAT == 'I'
  1434.             retTemp = system(cmd);
  1435. #else
  1436.             printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1437. #endif
  1438.             fflush(stdout);
  1439.        
  1440.             printf("Waiting for voltage change...\n");
  1441.             sleep(singlewait);
  1442.             vOut->widgetNE[0]->SetNumber(currentVoltage);
  1443.             gVirtualX->Update(1);
  1444.             printf("Continuing...\n");
  1445.        
  1446.             // Here comes function to start histogramming <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  1447.             RunMeas((void*)0, i, scanon); // TODO
  1448.             fflush(stdout);
  1449.  
  1450.             i++;
  1451.          }
  1452.  
  1453.          // Set output back to off
  1454.          fflush(stdout);
  1455.          printf("Measurement finished, returning to starting voltage...\n");
  1456.          sprintf(cmd, "%s/src/mpod/mpod_voltage.sh -o %d -v %f -s 1", rootdir, GetChannel(), minVoltage);
  1457.          vOut->widgetNE[0]->SetNumber(minVoltage);
  1458. #if WORKSTAT == 'I'
  1459.          retTemp = system(cmd);
  1460. #else
  1461.          printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1462. #endif
  1463.          fflush(stdout);
  1464.        
  1465.          progVal = 100.00;
  1466.          measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1467.          printf("\n");
  1468.  
  1469.          sprintf(cmd, "%s/dbg/finish_sig.txt", rootdir);
  1470.          pfin = fopen(cmd,"w");
  1471.          fprintf(pfin, "%s: Voltage scan finished.", timeStamp->widgetTE->GetText());
  1472.          fclose(pfin);
  1473.  
  1474.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1475.          acqStarted = false;
  1476.       }
  1477.    }
  1478.    // Surface scan
  1479.    else if( (pscan == 1) && (vscan == 0) && (ascan == 0) )
  1480.    {
  1481.       // If already started, stop the acquisition
  1482.       if(acqStarted)
  1483.       {
  1484.          printf("Stopping current surface scan...\n");
  1485.          gROOT->SetInterrupt();
  1486.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1487.          acqStarted = false;
  1488.  
  1489.          // Write information to the finish_sig.txt value
  1490.          sprintf(cmd, "%s/dbg/finish_sig.txt", rootdir);
  1491.          pfin = fopen(cmd,"w");
  1492.          fprintf(pfin, "%s: Surface scan stopped.", timeStamp->widgetTE->GetText());
  1493.          fclose(pfin);
  1494.       }
  1495.       // If stopped, start the acquisition
  1496.       else if(!acqStarted)
  1497.       {
  1498.          printf("Running a surface scan...\n");
  1499.  
  1500.          minXpos = xPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  1501.          maxXpos = xPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  1502.          stepXpos = xPosStep->widgetNE[0]->GetNumber();
  1503.          minYpos = yPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  1504.          maxYpos = yPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  1505.          stepYpos = yPosStep->widgetNE[0]->GetNumber();
  1506.          minZpos = zPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  1507.          maxZpos = zPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  1508.          stepZpos = zPosStep->widgetNE[0]->GetNumber();
  1509.  
  1510.          // Setting repetition for Z axis scan
  1511.          if(zscan == 1)
  1512.          {
  1513.             if(stepZpos == 0.)
  1514.                repetZ = 1;
  1515.             else
  1516.             {
  1517.                // Example: min = 40, max = 70, step = 5 (in increasing steps)
  1518.                if( (maxZpos > minZpos) && (stepZpos > 0) )
  1519.                   repetZ = ((maxZpos - minZpos)/stepZpos)+1;
  1520.                // Example: min = 70, max = 40, step = -5 (in decreasing steps)
  1521.                else if( (maxZpos < minZpos) && (stepZpos < 0) )
  1522.                   repetZ = ((minZpos - maxZpos)/stepZpos)-1;
  1523.                // Example: min = 70, max = 70 (no scan)
  1524.                else if( maxZpos == minZpos )
  1525.                   repetZ = 1;
  1526.                // If step is not correctly set, stop the acqusition
  1527.                else
  1528.                {
  1529.                   // TODO
  1530.                   printf("Stopping current surface scan (Z step error)...\n");
  1531.                   gROOT->SetInterrupt();
  1532.                   measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1533.                   acqStarted = false;
  1534.                   repetZ = 0;
  1535.                }
  1536.             }
  1537.          }
  1538.          else
  1539.          {
  1540.             minZpos = zPos->widgetNE[0]->GetNumber();
  1541.             repetZ = 1;
  1542.          }
  1543.  
  1544.          // Setting repetition for X axis
  1545.          if(stepXpos == 0.)
  1546.             repetX = 1;
  1547.          else
  1548.          {
  1549.             // Example: min = 40, max = 70, step = 5 (in increasing steps)
  1550.             if( (maxXpos > minXpos) && (stepXpos > 0) )
  1551.                repetX = ((maxXpos - minXpos)/stepXpos)+1;
  1552.             // Example: min = 70, max = 40, step = -5 (in decreasing steps)
  1553.             else if( (maxXpos < minXpos) && (stepXpos < 0) )
  1554.                repetX = ((minXpos - maxXpos)/stepXpos)-1;
  1555.             // Example: min = 70, max = 70 (no scan)
  1556.             else if( maxXpos == minXpos )
  1557.                repetX = 1;
  1558.             // If step is not correctly set, stop the acqusition
  1559.             else
  1560.             {
  1561.                // TODO
  1562.                printf("Stopping current surface scan (X step error)...\n");
  1563.                gROOT->SetInterrupt();
  1564.                measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1565.                acqStarted = false;
  1566.                repetX = 0;
  1567.             }
  1568.          }
  1569.          // Setting repetition for Y axis
  1570.          if(stepYpos == 0.)
  1571.             repetY = 1;
  1572.          else
  1573.          {
  1574.             // Example: min = 40, max = 70, step = 5 (in increasing steps)
  1575.             if( (maxYpos > minYpos) && (stepYpos > 0) )
  1576.                repetY = ((maxYpos - minYpos)/stepYpos)+1;
  1577.             // Example: min = 70, max = 40, step = -5 (in decreasing steps)
  1578.             else if( (maxYpos < minYpos) && (stepYpos < 0) )
  1579.                repetY = ((minYpos - maxYpos)/stepYpos)-1;
  1580.             // Example: min = 70, max = 70 (no scan)
  1581.             else if( maxYpos == minYpos )
  1582.                repetY = 1;
  1583.             // If step is not correctly set, stop the acqusition
  1584.             else
  1585.             {
  1586.                // TODO
  1587.                printf("Stopping current surface scan (Y step error)...\n");
  1588.                gROOT->SetInterrupt();
  1589.                measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1590.                acqStarted = false;
  1591.                repetY = 0;
  1592.             }
  1593.          }
  1594.  
  1595.          if(DBGSIG) printf("StartAcq(): X axis repetition (%lf,%lf,%lf) = %d\n", minXpos, maxXpos, stepXpos, repetX);
  1596.          if(DBGSIG) printf("StartAcq(): Y axis repetition (%lf,%lf,%lf) = %d\n", minYpos, maxYpos, stepYpos, repetY);
  1597.          if(DBGSIG) printf("StartAcq(): Z axis repetition (%lf,%lf,%lf) = %d\n", minZpos, maxZpos, stepZpos, repetZ);
  1598.  
  1599.          i = 0; j = 0; k = 0;
  1600.  
  1601.          // TODO - Setting button text and acqStarted do not work!
  1602.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Stop acquisition");
  1603.          acqStarted = true;
  1604.          progVal = 0.00;
  1605.          measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1606.          gVirtualX->Update(1);
  1607.  
  1608.          clkt0 = clock();
  1609.          timet0 = time(NULL);
  1610.  
  1611.          // Scan over Z axis
  1612.          while(1)
  1613.          {
  1614.             if( (repetZ > 0) && (k == repetZ) ) break;
  1615.             else if( (repetZ < 0) && (k == -repetZ) ) break;
  1616.             else if( repetZ == 0 ) break;
  1617.  
  1618.             fflush(stdout);
  1619.             // Z-axis change
  1620.             if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1621.                sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -c m", rootdir, (int)(minZpos + stepZpos*k), rootdir);
  1622.             else if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1623.                sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -c m", rootdir, (int)((minZpos + stepZpos*k)/lenconversion), rootdir);
  1624. #if WORKSTAT == 'I'
  1625.             retTemp = system(cmd);
  1626. #else
  1627.             printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1628. #endif
  1629.             fflush(stdout);
  1630.      
  1631.             printf("Next Z position...\n");
  1632.             sleep(2*doublewait);
  1633.             zPos->widgetNE[0]->SetNumber(minZpos + stepZpos*k);
  1634.             fflush(stdout);
  1635.  
  1636.             // Scan over Y axis
  1637.             while(1)
  1638.             {
  1639.                if( (repetY > 0) && (j == repetY) ) break;
  1640.                else if( (repetY < 0) && (j == -repetY) ) break;
  1641.                else if( repetY == 0 ) break;
  1642.  
  1643.                fflush(stdout);
  1644.                // Y-axis change
  1645.                if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1646.                   sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -c m", rootdir, (int)(minYpos + stepYpos*j), rootdir);
  1647.                else if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1648.                   sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -c m", rootdir, (int)((minYpos + stepYpos*j)/lenconversion), rootdir);
  1649. #if WORKSTAT == 'I'
  1650.                retTemp = system(cmd);
  1651. #else
  1652.                printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1653. #endif
  1654.                fflush(stdout);
  1655.      
  1656.                printf("Next Y position...\n");
  1657.                sleep(2*doublewait);
  1658.                yPos->widgetNE[0]->SetNumber(minYpos + stepYpos*j);
  1659.                fflush(stdout);
  1660.  
  1661.                // Scan over X axis
  1662.                while(1)
  1663.                {
  1664.                   if( (repetX > 0) && (i == repetX) ) break;
  1665.                   else if( (repetX < 0) && (i == -repetX) ) break;
  1666.                   else if( repetX == 0 ) break;
  1667.  
  1668.                   progVal = (float)(100.00/(abs(repetX)*abs(repetY)*abs(repetZ)))*(k*abs(repetX)*abs(repetY) + j*abs(repetX) + i);
  1669.                   measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1670.  
  1671.                   TimeEstimate(clkt0, timet0, progVal, cmd, doublewait*((abs(repetX)+2)*abs(repetY)+2)*abs(repetZ));
  1672.                   measProgress->widgetTE->SetText(cmd);
  1673.  
  1674.                   gVirtualX->Update(1);
  1675.  
  1676.                   // X-axis change
  1677.                   if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1678.                      sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -c m", rootdir, (int)(minXpos + stepXpos*i), rootdir);
  1679.                   else if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1680.                      sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -c m", rootdir, (int)((minXpos + stepXpos*i)/lenconversion), rootdir);
  1681. #if WORKSTAT == 'I'
  1682.                   retTemp = system(cmd);
  1683. #else
  1684.                   printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1685. #endif
  1686.                   fflush(stdout);
  1687.        
  1688.                   printf("Next X position...\n");
  1689.                   fflush(stdout);
  1690.      
  1691.                   printf("Waiting for position change...\n");
  1692.                   sleep(doublewait);
  1693.                   xPos->widgetNE[0]->SetNumber(minXpos + stepXpos*i);
  1694.                   printf("Continuing...\n");
  1695.      
  1696.                // Here comes function to start histogramming <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  1697.                   RunMeas((void*)0, (j*repetX + i), scanon);
  1698.      
  1699.                   fflush(stdout);
  1700.  
  1701.                   i++;
  1702.                }
  1703.  
  1704.                i = 0;
  1705.                printf("\n");
  1706.  
  1707.                j++;
  1708.             }
  1709.  
  1710.             j = 0;
  1711.  
  1712.             k++;
  1713.          }
  1714. printf("Time = %d\n", (int)time(NULL));
  1715.  
  1716.          fflush(stdout);
  1717.          printf("Measurement finished, returning to starting position...\n");
  1718.          // X-axis return
  1719.          if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1720.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -c m", rootdir, (int)minXpos, rootdir);
  1721.          else if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1722.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 1 -c m", rootdir, (int)(minXpos/lenconversion), rootdir);
  1723. #if WORKSTAT == 'I'
  1724.          retTemp = system(cmd);
  1725. #else
  1726.          printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1727. #endif
  1728.          fflush(stdout);
  1729.  
  1730.          // Y-axis return
  1731.          if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1732.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -c m", rootdir, (int)minYpos, rootdir);
  1733.          else if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1734.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 2 -c m", rootdir, (int)(minYpos/lenconversion), rootdir);
  1735. #if WORKSTAT == 'I'
  1736.          retTemp = system(cmd);
  1737. #else
  1738.          printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1739. #endif
  1740.  
  1741.          // Z-axis return
  1742.          if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1743.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -c m", rootdir, (int)minZpos, rootdir);
  1744.          else if( posUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1745.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 3 -c m", rootdir, (int)(minZpos/lenconversion), rootdir);
  1746. #if WORKSTAT == 'I'
  1747.          retTemp = system(cmd);
  1748. #else
  1749.          printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1750. #endif
  1751.          xPos->widgetNE[0]->SetNumber(minXpos);
  1752.          yPos->widgetNE[0]->SetNumber(minYpos);
  1753.          zPos->widgetNE[0]->SetNumber(minZpos);
  1754.  
  1755.          progVal = 100.00;
  1756.          measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1757.          printf("\n");
  1758.  
  1759.          // Write information to the finish_sig.txt value
  1760.          sprintf(cmd, "%s/dbg/finish_sig.txt", rootdir);
  1761.          pfin = fopen(cmd,"w");
  1762.          fprintf(pfin, "%s: Surface scan finished.", timeStamp->widgetTE->GetText());
  1763.          fclose(pfin);
  1764.  
  1765.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1766.          acqStarted = false;
  1767.       }
  1768.    }
  1769.    // Only angle scan
  1770.    if( (ascan == 1) && (pscan == 0) && (vscan == 0) )
  1771.    {
  1772.       // If already started, stop the acquisition
  1773.       if(acqStarted)
  1774.       {
  1775.          printf("Stopping current angle scan...\n");
  1776.          gROOT->SetInterrupt();
  1777.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1778.          acqStarted = false;
  1779.  
  1780.          // Write information to the finish_sig.txt value
  1781.          sprintf(cmd, "%s/dbg/finish_sig.txt", rootdir);
  1782.          pfin = fopen(cmd,"w");
  1783.          fprintf(pfin, "%s: Angle scan stopped.", timeStamp->widgetTE->GetText());
  1784.          fclose(pfin);
  1785.       }
  1786.       // If stopped, start the acquisition
  1787.       else if(!acqStarted)
  1788.       {
  1789.          printf("Running an incidence angle scan...\n");
  1790.  
  1791.          // Check the steps
  1792.          minAlpha = rotPosMin->widgetNE[0]->GetNumber();
  1793.          maxAlpha = rotPosMax->widgetNE[0]->GetNumber();
  1794.          stepAlpha = rotPosStep->widgetNE[0]->GetNumber();
  1795.  
  1796.          if(stepAlpha == 0.)
  1797.             repetAlpha = 1;
  1798.          else
  1799.          {
  1800.             // Example: min = 40, max = 70, step = 5 (in increasing steps)
  1801.             if( (maxAlpha > minAlpha) && (stepAlpha > 0) )
  1802.                repetAlpha = ((maxAlpha - minAlpha)/stepAlpha)+1;
  1803.             // Example: min = 70, max = 40, step = -5 (in decreasing steps)
  1804.             else if( (maxAlpha < minAlpha) && (stepAlpha < 0) )
  1805.                repetAlpha = ((minAlpha - maxAlpha)/stepAlpha)-1;
  1806.             // Example: min = 70, max = 70 (no scan)
  1807.             else if( maxAlpha == minAlpha )
  1808.                repetAlpha = 1;
  1809.             // If step is not correctly set, stop the acqusition
  1810.             else
  1811.             {
  1812.                // TODO
  1813.                printf("Stopping current incidence angle scan...\n");
  1814.                gROOT->SetInterrupt();
  1815.                measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1816.                acqStarted = false;
  1817.                repetAlpha = 0;
  1818.             }
  1819.          }
  1820.  
  1821.          if(DBGSIG) printf("StartAcq(): Angle repetition (%lf,%lf,%lf) = %d\n", minAlpha, maxAlpha, stepAlpha, repetAlpha);
  1822.  
  1823.          int angleWait = TMath::Ceil(abs(rotPos->widgetNE[0]->GetNumber()-minAlpha)*15/(rotPos->widgetNE[0]->GetNumMax()));
  1824.          if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1825.          {
  1826.             minAlpha = minAlpha/rotconversion;
  1827.             maxAlpha = maxAlpha/rotconversion;
  1828.             stepAlpha = stepAlpha/rotconversion;
  1829.          }
  1830.  
  1831.          i = 0;
  1832.  
  1833.          // TODO - Setting button text and acqStarted do not work!
  1834.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Stop acquisition");
  1835.          acqStarted = true;
  1836.          progVal = 0.00;
  1837.          measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1838.          gVirtualX->Update(1);
  1839.  
  1840.          clkt0 = clock();
  1841.          timet0 = time(NULL);
  1842.  
  1843.          // Setting angle to initial position
  1844.          sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -c m", rootdir, (int)minAlpha, rootdir);
  1845.          if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1846.             rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(minAlpha);
  1847.          else if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1848.             rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(minAlpha*rotconversion);
  1849. #if WORKSTAT == 'I'
  1850.             retTemp = system(cmd);
  1851. #else
  1852.             printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1853. #endif
  1854.             fflush(stdout);
  1855.        
  1856.             printf("Waiting for %ds for rotation platform to move into starting position...\n", angleWait);
  1857.             sleep(angleWait);
  1858.  
  1859.          while(1)
  1860.          {
  1861.             if( (repetAlpha > 0) && (i == repetAlpha) ) break;
  1862.             else if( (repetAlpha < 0) && (i == -repetAlpha) ) break;
  1863.             else if( repetAlpha == 0 ) break;
  1864.  
  1865.             progVal = (float)(100.00/abs(repetAlpha))*i;
  1866.             measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1867.  
  1868.             TimeEstimate(clkt0, timet0, progVal, cmd, singlewait*abs(repetAlpha));
  1869.             measProgress->widgetTE->SetText(cmd);
  1870.  
  1871.             gVirtualX->Update(1);
  1872.        
  1873.             fflush(stdout);
  1874.             currentAlpha = minAlpha + stepAlpha*i;
  1875.             sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -c m", rootdir, (int)currentAlpha, rootdir);
  1876. #if WORKSTAT == 'I'
  1877.             retTemp = system(cmd);
  1878. #else
  1879.             printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1880. #endif
  1881.             fflush(stdout);
  1882.        
  1883.             printf("Waiting for angle change...\n");
  1884.             sleep(singlewait);
  1885.             if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1886.                rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(currentAlpha);
  1887.             else if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1888.                rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(currentAlpha*rotconversion);
  1889.             gVirtualX->Update(1);
  1890.             printf("Continuing...\n");
  1891.        
  1892.             // Here comes function to start histogramming <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  1893.             RunMeas((void*)0, i, scanon); // TODO
  1894.             fflush(stdout);
  1895.  
  1896.             i++;
  1897.          }
  1898.        
  1899.          // Set angle back to original position
  1900.          fflush(stdout);
  1901.          printf("Measurement finished, returning to starting incidence angle...\n");
  1902.          sprintf(cmd, "sudo %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -v %d -s la && %s/src/MIKRO/mikro_ctrl -n 4 -c m", rootdir, (int)minAlpha, rootdir);
  1903.          if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 0)
  1904.             rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(minAlpha);
  1905.          else if(rotUnits->widgetCB->GetSelected() == 1)
  1906.             rotPos->widgetNE[0]->SetNumber(minAlpha*rotconversion);
  1907. #if WORKSTAT == 'I'
  1908.          retTemp = system(cmd);
  1909. #else
  1910.          printf("Cmd: %s\n",cmd);
  1911. #endif
  1912.          fflush(stdout);
  1913.        
  1914.          progVal = 100.00;
  1915.          measProgress->widgetPB->SetPosition(progVal);
  1916.          printf("\n");
  1917.  
  1918.          sprintf(cmd, "%s/dbg/finish_sig.txt", rootdir);
  1919.          pfin = fopen(cmd,"w");
  1920.          fprintf(pfin, "%s: Incidence angle scan finished.", timeStamp->widgetTE->GetText());
  1921.          fclose(pfin);
  1922.  
  1923.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1924.          acqStarted = false;
  1925.       }
  1926.    }
  1927.    // Normal single measurement
  1928.    else if( (vscan == 0) && (pscan == 0) && (ascan == 0) )
  1929.    {
  1930.       // Set the start button to stop and enable stopping of measurement
  1931.       if(acqStarted)
  1932.       {
  1933.          printf("Stopping current single scan...\n");
  1934.          gROOT->SetInterrupt();
  1935.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1936.          acqStarted = false;
  1937.       }
  1938.       else if(!acqStarted)
  1939.       {
  1940.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Stop acquisition");
  1941.          acqStarted = true;
  1942.  
  1943.          printf("Running a single scan...\n");
  1944.          clkt0 = clock();
  1945.          timet0 = time(NULL);
  1946.          RunMeas((void*)0, 0, scanon);
  1947.          printf("Measurement finished...\n");
  1948.          printf("\n");
  1949.  
  1950.          measProgress->widgetTB[0]->SetText("Start acquisition");
  1951.          acqStarted = false;
  1952.       }
  1953.    }
  1954. }
  1955.  
  1956. // Main measurement window connections ----------------------
  1957.  
  1958. // Histogram file selection pane connections ----------------
  1959.  
  1960. // File browser for opening histograms
  1961. void TGAppMainFrame::SelectDirectory()
  1962. {
  1963.    int i = fileList->GetNumberOfEntries();
  1964.    char *cTemp;
  1965.  
  1966.    TGFileInfo file_info;
  1967.    const char *filetypes[] = {"Histograms",histextall,0,0};
  1968.    file_info.fFileTypes = filetypes;
  1969.    cTemp = new char[1024];
  1970.    sprintf(cTemp, "%s/results", rootdir);
  1971.    file_info.fIniDir = StrDup(cTemp);
  1972.    file_info.fMultipleSelection = kTRUE;
  1973.    new TGFileDialog(gClient->GetDefaultRoot(), fMain, kFDOpen, &file_info);
  1974.    delete[] cTemp;
  1975.  
  1976.    TList *files = file_info.fFileNamesList;
  1977.    if(files)
  1978.    {
  1979.       TSystemFile *file;
  1980.       TString fname;
  1981.       TIter next(files);
  1982.       while(file=(TSystemFile*)next())
  1983.       {
  1984.          fname = file->GetName();
  1985.          fileList->AddEntry(fname.Data(), i);
  1986.          i++;
  1987.       }
  1988.    }
  1989.    fileList->Layout();
  1990. }
  1991.  
  1992. // Toggle multiple selection in filelist or delete all entries
  1993. void TGAppMainFrame::ListMultiSelect(int opt)
  1994. {
  1995.    // Enable multiselect
  1996.    if(opt == 0)
  1997.    {
  1998.       fileList->SetMultipleSelections((multiSelect->widgetChBox[0]->IsOn()));
  1999.  
  2000.       if(multiSelect->widgetChBox[1]->IsDown())
  2001.          multiSelect->widgetChBox[1]->SetState(kButtonUp);
  2002.    }
  2003.    else if(opt == 1)
  2004.    {
  2005.       if(multiSelect->widgetChBox[1]->IsDown())
  2006.       {
  2007.          multiSelect->widgetChBox[0]->SetState(kButtonDown);
  2008.          fileList->SetMultipleSelections((multiSelect->widgetChBox[0]->IsOn()));
  2009.          for(int i = 0; i < fileList->GetNumberOfEntries(); i++)
  2010.             fileList->Select(i,kTRUE);
  2011.       }
  2012.       else if(!multiSelect->widgetChBox[1]->IsDown())
  2013.       {
  2014.          multiSelect->widgetChBox[0]->SetState(kButtonUp);
  2015.          fileList->SetMultipleSelections((multiSelect->widgetChBox[0]->IsOn()));
  2016.          for(int i = 0; i < fileList->GetNumberOfEntries(); i++)
  2017.             fileList->Select(i,kFALSE);
  2018.       }
  2019.    }
  2020. }
  2021.  
  2022. // Navigation buttons for the filelist (<<, >>) and double click
  2023. void TGAppMainFrame::FileListNavigation(int opt)
  2024. {
  2025.    unsigned int nrfiles = fileList->GetNumberOfEntries();
  2026.    int curSel;
  2027.    TList *files;
  2028.    if( nrfiles > 0 )
  2029.    {
  2030.       if(opt < -1)
  2031.       {
  2032.          // turn off multiple selection and select first file on list
  2033.          if(multiSelect->widgetChBox[0]->IsOn())
  2034.          {
  2035.             fileList->SetMultipleSelections(kFALSE);
  2036.             multiSelect->widgetChBox[0]->SetState(kButtonUp);
  2037.             multiSelect->widgetChBox[1]->SetState(kButtonUp);
  2038.  
  2039.             fileList->Select(0,kTRUE);
  2040.          }
  2041.          else
  2042.          {
  2043.             // if nothing is selected, curSel will be -1
  2044.             curSel = fileList->GetSelected();
  2045.             // go to next file on list
  2046.             if(opt == -3)
  2047.             {
  2048.                if( (curSel == (int)(nrfiles-1)) || (curSel == -1) )
  2049.                   fileList->Select(0);
  2050.                else
  2051.                   fileList->Select(curSel+1);
  2052.             }
  2053.             // go to previous file on list
  2054.             else if(opt == -2)
  2055.             {
  2056.                if( (curSel == 0) || (curSel == -1) )
  2057.                   fileList->Select(nrfiles-1);
  2058.                else
  2059.                   fileList->Select(curSel-1);
  2060.             }
  2061.          }
  2062.       }
  2063.    }
  2064.  
  2065.    UpdateHistogram(0);
  2066. }
  2067.  
  2068. // Open the header edit window when pressing on editHeader button
  2069. void TGAppMainFrame::HeaderEdit()
  2070. {
  2071.    bool createTab = true;
  2072.    int tabid = -1;
  2073.  
  2074.    for(int i = 0; i < fTab->GetNumberOfTabs(); i++)
  2075.    {
  2076.       if(strcmp("File header editor", fTab->GetTabTab(i)->GetString() ) == 0)
  2077.       {
  2078.          createTab = false;
  2079.          tabid = i;
  2080.       }
  2081.      
  2082.       if(DBGSIG > 1) printf("HeaderEdit(): Name of tab = %s\n", fTab->GetTabTab(i)->GetString() );
  2083.    }
  2084.  
  2085.    unsigned int nrfiles = fileList->GetNumberOfEntries();
  2086.    if(nrfiles > 0)
  2087.       HeaderEditTab(fTab, createTab, &tabid);
  2088. }
  2089.  
  2090. // Clear the histogram file selection list and dark run analysis selection
  2091. void TGAppMainFrame::ClearHistogramList()
  2092. {
  2093.    fileList->RemoveAll();
  2094.    darkRun->widgetTE->Clear();
  2095. }
  2096.  
  2097. // Histogram file selection pane connections ----------------
  2098.  
  2099. // Histogram controls pane connections ----------------------
  2100.  
  2101. // Readjust the histogram range after changing ADC, TDC, Y range or logarithmic scale (opt: 0 = normal redraw, 1 = export, 2 = redraw when changing which channel to display)
  2102. void TGAppMainFrame::UpdateHistogram(int opt)
  2103. {
  2104.    if(DBGSIG > 1)
  2105.    {
  2106.       printf("UpdateHistogram(): Clearing the TList\n");
  2107.       gDirectory->GetList()->Delete();
  2108.       gObjectTable->Print();
  2109.    }
  2110.  
  2111.    // Do not do normal histogram update if we have multiple files selected
  2112.    if( (opt == 0) && (multiSelect->widgetChBox[0]->IsDown()) )
  2113.    {
  2114.       printf("UpdateHistogram(): To preview changes done to a histogram, please deselect the \"Multiple files select\" option.");
  2115.       return;
  2116.    }
  2117.  
  2118.    // Do not update histogram if we are on the same channel
  2119.    if( ((opt == 2) && (selChannel != (int)selectCh->widgetNE[0]->GetNumber())) || (opt < 2) )
  2120.    {
  2121.       unsigned int nrfiles = fileList->GetNumberOfEntries();
  2122.       TCanvas *gCanvas;
  2123.       char exportname[512];
  2124.       char cTemp[512];
  2125.    
  2126.       if(opt == 1)
  2127.          gCanvas = analysisCanvas->GetCanvas();
  2128.    
  2129.       if(nrfiles > 0)
  2130.       {
  2131.          TList *files;
  2132.          files = new TList();
  2133.          fileList->GetSelectedEntries(files);
  2134.          
  2135.          if(files)
  2136.          {
  2137.             for(int i = 0; i < (int)nrfiles; i++)
  2138.             {
  2139.                if(files->At(i))
  2140.                {
  2141.                   if(DBGSIG)
  2142.                      printf("UpdateHistogram(): Filename: %s\n", files->At(i)->GetTitle());
  2143.                   if(opt == 1)
  2144.                      remove_ext((char*)files->At(i)->GetTitle(), cTemp);
  2145.                   if( fMenuHisttype->IsEntryChecked(M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DADC) )
  2146.                   {
  2147.                      sprintf(exportname, "%s_adc%d.pdf", cTemp, (int)selectCh->widgetNE[0]->GetNumber());
  2148.                      DisplayHistogram( (char*)(files->At(i)->GetTitle()), 0, opt);
  2149.                   }
  2150.                   else if( fMenuHisttype->IsEntryChecked(M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DTDC) )
  2151.                   {
  2152.                      sprintf(exportname, "%s_tdc%d.pdf", cTemp, (int)selectCh->widgetNE[0]->GetNumber());
  2153.                      DisplayHistogram( (char*)(files->At(i)->GetTitle()), 1, opt);
  2154.                   }
  2155.                   else if( fMenuHisttype->IsEntryChecked(M_ANALYSIS_HISTTYPE_2D) )
  2156.                   {
  2157.                      sprintf(exportname, "%s_adctdc%d.pdf", cTemp, (int)selectCh->widgetNE[0]->GetNumber());
  2158.                      DisplayHistogram( (char*)(files->At(i)->GetTitle()), 2, opt);
  2159.                   }
  2160.    
  2161.                   if(opt == 1)
  2162.                   {
  2163.                      gCanvas->SaveAs(exportname);
  2164.                      delete inroot;
  2165.                   }
  2166.                }
  2167.             }
  2168.          }
  2169.       }
  2170.       selChannel = selectCh->widgetNE[0]->GetNumber();
  2171.    }
  2172.  
  2173.    if(DBGSIG > 1)
  2174.    {
  2175.       printf("UpdateHistogram(): After drawing histograms (connections)\n");
  2176.       gObjectTable->Print();
  2177.    }
  2178. }
  2179.  
  2180. // Options for histogram (logarithmic scale, clean plots)
  2181. void TGAppMainFrame::HistogramOptions(int opt)
  2182. {
  2183.    // Logarithmic scale
  2184.    if(opt == 0)
  2185.       UpdateHistogram(0);
  2186.    // Clean plots
  2187.    else if(opt == 1)
  2188.    {
  2189.       cleanPlots = histOpt->widgetChBox[1]->IsDown();
  2190.       UpdateHistogram(0);
  2191.    }
  2192. }
  2193.  
  2194. // Changing the histogram type to display
  2195. void TGAppMainFrame::ChangeHisttype(int type)
  2196. {
  2197.    TGTextButton *pressedB = new TGTextButton();
  2198.    int menuID = 0;
  2199.    unsigned int nrfiles = fileList->GetNumberOfEntries();
  2200.  
  2201.    // ADC histogram
  2202.    if(type == 0)
  2203.    {
  2204.       pressedB = plotType->widgetTB[0];
  2205.       menuID = M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DADC;
  2206.  
  2207.       plotType->widgetTB[1]->SetDown(kFALSE);
  2208.       plotType->widgetTB[2]->SetDown(kFALSE);
  2209.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DTDC);
  2210.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(M_ANALYSIS_HISTTYPE_2D);
  2211.    }
  2212.    // TDC histogram
  2213.    else if(type == 1)
  2214.    {
  2215.       pressedB = plotType->widgetTB[1];
  2216.       menuID = M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DTDC;
  2217.  
  2218.       plotType->widgetTB[0]->SetDown(kFALSE);
  2219.       plotType->widgetTB[2]->SetDown(kFALSE);
  2220.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DADC);
  2221.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(M_ANALYSIS_HISTTYPE_2D);
  2222.    }
  2223.    // ADC vs. TDC histogram
  2224.    else if(type == 2)
  2225.    {
  2226.       pressedB = plotType->widgetTB[2];
  2227.       menuID = M_ANALYSIS_HISTTYPE_2D;
  2228.  
  2229.       plotType->widgetTB[0]->SetDown(kFALSE);
  2230.       plotType->widgetTB[1]->SetDown(kFALSE);
  2231.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DADC);
  2232.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(M_ANALYSIS_HISTTYPE_1DTDC);
  2233.    }
  2234.  
  2235.    if( fMenuHisttype->IsEntryChecked(menuID) )
  2236.    {
  2237.       pressedB->SetDown(kFALSE);
  2238.       fMenuHisttype->UnCheckEntry(menuID);
  2239.    }
  2240.    else if( !fMenuHisttype->IsEntryChecked(menuID) )
  2241.    {
  2242.       pressedB->SetDown(kTRUE);
  2243.       fMenuHisttype->CheckEntry(menuID);
  2244.    }
  2245.  
  2246.    UpdateHistogram(0);
  2247. }
  2248.  
  2249. // Histogram controls pane connections ----------------------
  2250.