Subversion Repositories f9daq

//////////////////////////////////////////

// Data to root conversion root script

//

// Contributors: Rok Pestotnik, Rok Dolenec, Dino Tahirovic

//

// 3/1/2014 TDC cut relative to tdc offset

// 5/3/2014 TH3F h_correctedTDC; commented 'delete' commands

// 12/3/2014 declarations of all histos before while{}

#include "stdio.h"

#include "TROOT.h"

#include "TFile.h"

#include "TNtuple.h"

#include "TH1F.h"

#include "TH2F.h"

#include "TH3F.h"

#include "TF1.h"

#include "TMath.h"

#include "TStyle.h"

#include "TCanvas.h"

#include "TLine.h"

#include "zlib.h"

// ------------------------------------------------------------------------------

#define POSMARG 1000

#define READBUFFERLENGTH 10000

// data format

#define MAXDATA 16

#define NCH 64

#define TDC_BIN 1.0416 // 1 TDC bin in ns

#define MIKRO_BIN 0.49609/1000. //1 mikro step in mm; stage MM3MF

#define OFFSETX 4800  // Right edge of SiPM+Lightguide

#define OFFSETY 3400 // Lower edge of SiPM+Lightguide

#define RUNREC_ID 1

#define ENDREC_ID 2

#define POSREC_ID 3

#define EVTREC_ID 4

#define THRREC_ID 5

#define BIASREC_ID 6

typedef struct {

  unsigned int id,len;

  unsigned int fver,time;

  unsigned int thLow, thUp, thStep;

  unsigned int biasLow, biasUp, biasStep;

  unsigned int nev,nch,ped,xy;

  int nx,x0,dx,ny,y0,dy;

} RUNREC;

RUNREC *runrec;

RUNREC run;

typedef struct {

  unsigned int id,len;

  unsigned int time;

} ENDREC;

ENDREC *endrec;

typedef struct {

  unsigned int id,len;

  unsigned int time;

  int ix;

  int x;

  int xset;

  int iy;

  int y;

  int yset;

} POSREC;

POSREC *posrec;

POSREC pos;

typedef struct {

    unsigned int id;

    unsigned int len;

    unsigned int nev;

    } EVTREC;

EVTREC *evtrec;

typedef struct {

  unsigned int id;

  unsigned int len;

  unsigned int threshold;

} THRREC;

THRREC *thrrec;

THRREC thr;

typedef struct {

  unsigned int id;

  unsigned int len;

  unsigned int bias;

} BIASREC;

BIASREC *biasrec;

BIASREC bias;

double padCenter[NCH][2];

int position(int, int, int);

// ------------------------------------------------------------------------------

int analysisBias(char* dfile0="test", int dbg=0, double tdcCut=5.0)

{

  const double c_tdcOffset = 1; // ns

  printf(" Data to root conversion program\nUsage:\nd2r(input file name <without.dat>, debug on/off, TDC cut +-[ns])\n\n");

  char fullname[256];

  char sbuff[256];

  FILE *fp;

  //Chanel information

  double tdcOffset[NCH];

  sprintf(fullname, "d2r.ini");

  if( (fp=fopen(fullname, "rt")) == NULL )

    printf("Cannot open pad centers file %s !!!\n", fullname);

  else {

    printf("Opened pad centers file %s\n", fullname);

    char* result = fgets(sbuff,256, fp);

    if (dbg) printf("Read buffer %s\n", result);

    printf("%s", sbuff);

    for(int i=0; i<NCH; i++) {

      int channel;

      int message = fscanf(fp, "%d %lf %lf %lf\n", &channel, &padCenter[i][0], &padCenter[i][1], &tdcOffset[i]);

      if (dbg) printf("Read d2r.ini returned %d\n", message);

    }

    fclose(fp);

  }

  for(int i=0; i<NCH; i++) {

    tdcOffset[i] += c_tdcOffset;

    printf("%.2lf %.2lf %.2lf\n", padCenter[i][0], padCenter[i][1], tdcOffset[i]);

    }

        //data buffer

        unsigned int readbuf[READBUFFERLENGTH];

        unsigned int buf[READBUFFERLENGTH];

        //data file

        gzFile dfp;

        char dfile[256];

        int ftype=0;

        int fcount=1;

        do {

          switch(ftype++) {

            case 0:

              sprintf(dfile, "./data/%s_file%02d.dat", dfile0, fcount);

              break;

            case 1:

              sprintf(dfile, "./data/%s_file%02d.dat.gz", dfile0, fcount);

              break;

            case 2:

              sprintf(dfile, "./data/%s_file%02d.gz", dfile0, fcount);

              break;

            default:

        printf("  Cannot find data file for %s !!!\n", dfile0);

        return -1;

          }

          dfp=gzopen(dfile,"rb");

        } while(!dfp);

        printf("Opened data file %s\n", dfile);

        //opens ROOT file 

        char fnameroot[256];

        sprintf(fnameroot, "root/%s.root", dfile0);

        TFile rootfile(fnameroot,"RECREATE",dfile0);

        if (rootfile.IsZombie()) {

       std::cout << "Error opening file" << std::endl;

       exit(-1);

  }

  if (rootfile.IsOpen()) std::cout << "ROOT file opened for writing." << std::endl;

  // -----------------------------------------------

        // loop trough records

        unsigned int rec_id, rec_len;

        unsigned int ulsize = sizeof(unsigned int);

        //unsigned int ulsize = 4;

        if (dbg) printf("Size of unsigned int: %lu\n", sizeof(unsigned int));

        int ceve=0;

        int end_of_file = 0;

        int ii;

        int nint;

        int nb;

        int status;

        char hname[256];

        TH2F* htdc = new TH2F("htdc",";TDC channel;SiPM channel",512,-0.5,511.5,NCH,-0.5,NCH-0.5);

  TH3F* h_correctedTDC = new TH3F("h_correctedTDC",";SiPM channel; ASD threshold [V]; t [ns]",

                                                          NCH, -0.5, NCH-0.5,

                                                          101,  1.0, 2.0,

                                                          33, -16.5*TDC_BIN, 16.5*TDC_BIN);

        TH1F* hnhitsx[NCH]; // move to 2d with (channel, position)

        TH1F* hnhitsy[NCH]; //-||-

        TH2F* h2d[NCH];     //-||-

        TH2F* h_bias = new TH2F("h_bias", "", 64, 0, 63, 20, 71.0,73.0);

        TH2F* h_threshold = new TH2F("h_threshold",";SiPM ch;Threshold[V]",

                                                    64,-0.5,63.5,

                                                                      101, 1.0, 2.0);

        TH2F* h_ch33 = new TH2F("h_ch33","ch. 33;x;y",100,20000,30000,100,0,10000);

        TNtuple* nt = new TNtuple("nt", "nt", "ch:x:y:tdc");

        while(1) {     

                if(gzeof(dfp)) end_of_file = 1;        

                gzread(dfp, (voidp)&readbuf, 2*ulsize);

                rec_id=readbuf[0];

                rec_len=readbuf[1];

                if(dbg) printf("-----------------------------------------------\n");

                if(dbg) printf("[%d] rec_id = %d | rec_len = %u\n", ceve, rec_id, rec_len);

    int nSteps = 0;

    int nBiasSteps = 0;

                switch(rec_id)

                {              

                        case RUNREC_ID:

                          if (dbg) printf("RUNREC\n");

                                gzread(dfp, (voidp)&readbuf[2], (rec_len-2*ulsize));

                                runrec = (RUNREC *) readbuf;

                          run=*runrec;

                                if(dbg) {

                                        printf("RUNREC_ID\n");

                                        printf("id = %d, len = %d, time = %d\n", run.id, run.len, run.time);

                                        printf("nev = %d, nch = %d\n", run.nev, run.nch);

                                        printf("nx = %d, x0 = %d, dx = %d\n", run.nx, run.x0, run.dx);

                                        printf("ny = %d, y0 = %d, dy = %d\n", run.ny, run.y0, run.dy);

                                        printf("thLow = %d, thUp = %d, thStep = %d\n", run.thLow, run.thUp, run.thStep);

                                }

                                //create histograms

                                //nt = (TNtuple*) gROOT->FindObject("nt");

                                //if (nt) delete nt;

                                //sprintf(hname, "htdc");

                                //htdc = (TH2F*) gROOT->FindObject(hname);

                                //if (htdc) delete htdc;

                                //htdc = new TH2F("htdc",";TDC channel;SiPM channel",512,0,512,NCH,0,NCH);

                                h_correctedTDC = (TH3F*) gROOT->FindObject("h_correctedTDC");

                                if (h_correctedTDC) delete h_correctedTDC;

                                nSteps = (run.thUp - run.thLow)/double(run.thStep) + 1;

                                if (dbg) printf("nSteps %d\n", nSteps);

                                h_correctedTDC = new TH3F("h_correctedTDC",";SiPM channel; ASD threshold [V]; t [ns]",

                                                          NCH,

                                                          -0.5,

                                                          NCH-0.5,

                                                          nSteps,  

                                                          (run.thLow - 0.5*run.thStep)/1000.0,

                                                          (run.thUp  + 0.5*run.thStep)/1000.0,

                                                          2*tdcCut*TDC_BIN,

                                                          -tdcCut*TDC_BIN,

                                                          tdcCut*TDC_BIN);

        //TH1F* gsumV673A[NCH/16] = new TH1F(hn,hname,256,-0.5,255.5);

                                for(int i=0; i<NCH; i++) {

                                  /*   

                                        sprintf(hname, "htdcpos%d", i);

                                        htdcpos[i] = (TH1F*)gROOT->FindObject(hname);

                                        if(htdcpos[i]) delete htdcpos[i];

                                        htdcpos[i] = new TH1F(hname, hname, 512, 0, 512*TDC_BIN);

                                        sprintf(hname, "htdc%d", i);

                                        htdc[i] = (TH1F*)gROOT->FindObject(hname);

                                        if(htdc[i]) delete htdc[i];

                                        htdc[i] = new TH1F(hname, hname, 512, 0*TDC_BIN, 512*TDC_BIN);

                                        */

                                        sprintf(hname, "hnhitsx%d", i);

                                        hnhitsx[i] = (TH1F*)gROOT->FindObject(hname);

                                        if(hnhitsx[i]) delete hnhitsx[i];

                                        hnhitsx[i] = new TH1F(hname, hname, run.nx,

                                                                            (run.x0 - OFFSETX - 0.5*run.dx)*MIKRO_BIN,

                                                                            (run.x0 - OFFSETX + (run.nx-0.5)*run.dx)*MIKRO_BIN);

                                        sprintf(hname, "hnhitsy%d", i);

                                        hnhitsy[i] = (TH1F*)gROOT->FindObject(hname);

                                        if(hnhitsy[i]) delete hnhitsy[i];

                                        //hnhitsy[i] = new TH1F(hname, hname, run.ny, (run.y0-0.5*run.dy)*MIKRO_BIN, (run.y0+(run.ny-0.5)*run.dy)*MIKRO_BIN);

                                        hnhitsy[i] = new TH1F(hname, hname, run.ny,

                                                                            (run.y0 - 0.5*run.dy - OFFSETY)*MIKRO_BIN,

                                                                            (run.y0 + (run.ny-0.5)*run.dy - OFFSETY)*MIKRO_BIN);

                                        //hnhitsy[i] = new TH1F(hname, hname, 100, 0,100);

                                        sprintf(hname, "h2d%d", i);

                                        h2d[i] = (TH2F*)gROOT->FindObject(hname);

                                        if(h2d[i]) delete h2d[i];

                                        h2d[i] = new TH2F(hname, hname, run.nx,

                                                                        (run.x0 - OFFSETX - 0.5*run.dx)*MIKRO_BIN,

                                                                        (run.x0 - OFFSETX + (run.nx-0.5)*run.dx)*MIKRO_BIN,

                                                                        run.ny,

                                                                        (run.y0 - OFFSETY - 0.5*run.dy)*MIKRO_BIN,

                                                                        (run.y0 - OFFSETY + (run.ny-0.5)*run.dy)*MIKRO_BIN);

                                }

                                nBiasSteps = (run.biasUp - run.biasLow)/double(run.biasStep) + 1;

                                h_bias = (TH2F*) gROOT->FindObject("h_bias");

                                if (h_bias) delete h_bias;

                                h_bias = new TH2F("h_bias",";Channel; Bias [V]", 64, -0.5, 63.5,

                                                                nBiasSteps,

                                                               (run.biasLow - 0.5*run.biasStep)/1000.0,

                                                               (run.biasUp  + 0.5*run.biasStep)/1000.0);

                                if (h_threshold) delete h_threshold;

                                h_threshold = new TH2F("h_threshold",";SiPM ch;Threshold[V]",64,-0.5,63.5,

                                                                      nSteps,

                                                                      (run.thLow - 0.5*run.thStep)/1000.0,

                                                                      (run.thUp  + 0.5*run.thStep)/1000.0);

                                //h_threshold = new TH2F("h_threshold","Threshold scan;SiPM ch;Threshold[mV]",64,-0.5,63.5,

                                //                                      101,995,2005);

                                if (h_ch33) delete h_ch33;

                                h_ch33 = new TH2F("h_ch33","ch. 33;x;y",100,20000,30000,100,0,10000);

                                if (dbg) printf("RUNREC: all histos created.\n");

                                break;

                        case POSREC_ID:

                          if (dbg) printf("POSREC\n");

                                gzread(dfp, (voidp)&readbuf[2], (rec_len-2*ulsize));

                                posrec = (POSREC *) readbuf;

                                pos=*posrec;

                                if(dbg) {

                                        printf("POSREC_ID\n");

                                        printf("id = %d, len = %d, time = %d\n", posrec->id, posrec->len, posrec->time);

                                        printf("ix = %d, x = %d, xset = %d\n", posrec->ix, posrec->x, posrec->xset);

                                        printf("iy = %d, y = %d, yset = %d\n", posrec->iy, posrec->y, posrec->yset);

                                } else  printf("        [%d,%d] %d, %d\n", pos.ix, pos.iy, pos.xset, pos.yset);

                                break;

                        case EVTREC_ID:

                          gzread(dfp, (voidp)&readbuf[2], ulsize); // last field of event record

                          evtrec = (EVTREC *) readbuf;

                          //evtrec->nev = buf[0];

                          //if (rec_len < 0 || rec_len > 10000) {

                          if (rec_len > READBUFFERLENGTH) {

                            printf("Len %u\n", rec_len);

                            return(1);

                            }

                          nb = rec_len - 3*ulsize; // no. of bytes to read

                                gzread(dfp, (voidp)&buf, nb);

                                if(dbg) {

                                        printf("EVTREC_ID\n");

                                        printf("id = %d, len = %d, nev = %d\n", evtrec->id, evtrec->len, evtrec->nev);

                                        //for(int datai = 0; datai < NCH; datai++) printf("%u ", evtrec->data[datai]);

                                        //printf("\n");

                                        //for(int datai = NCH; datai < NCH+NCH; datai++) printf("%u ", evtrec->data[datai]);

                                        //printf("\n");

                                        break;

                                }

                                nint = nb / ulsize; // no. of subrecords

                                if (dbg) printf("No. of subrecords %d \n", nint);

                                ii=0;

        while (ii<nint){

          int recid = buf[ii++];

          int len   = buf[ii++];

          if (dbg) printf("Buffer pointer %d\n", ii);    

          unsigned int *dbuf = (unsigned int *)&buf[ii];

          //if (n%1000==0) 

                if (dbg) printf("%d 0x%03x Len=%d\n",evtrec->nev,recid,len);

          //unsigned short edge;

          //int nhits;

                                  if (recid==0x140 || recid==0x141) {

            for (int i=0; i<len; i++) {

              int data      =  dbuf[i] & 0xFFFF ;

              int edge_type = (dbuf[i]>>16)&0x1  ;

              int overflow  = (dbuf[i]>>17)&0x1  ;

              int tdc_num   = (dbuf[i]>>25)&0x1  ;

              int channel   = ((dbuf[i]>>18)&0x1F) | tdc_num<<5 ;

              int ev_dat    = (dbuf[i]>>23)&0x1  ;    

              int last_dat  = (dbuf[i]>>30)&0x1  ;

              int nval_dat  = (dbuf[i]>>31)&0x1  ;

              if (dbg){

                if (ev_dat) printf("Event %d\n",data);

                else printf("ch=%d edge=%d ev=%d data=%d last=%d nval=%d\n",

                channel, edge_type,ev_dat,data,last_dat,nval_dat);

              }            

              if (!ev_dat){

                if (!edge_type && !overflow) {

                  htdc->Fill(data, channel);

                  if (dbg) printf("ch: %d tdc: %d\n", channel, data);

                  if (dbg) nt->Fill(channel, pos.ix, pos.iy, data);

                  double tdcmin = tdcOffset[channel] - tdcCut;

                  double tdcmax = tdcOffset[channel] + tdcCut;

                  double time = data*TDC_BIN - tdcOffset[channel];

                  if(time >= -tdcCut and time <= tdcCut) {

                    h_correctedTDC->Fill(channel, thr.threshold/1000.0, time);

                    hnhitsx[channel]->Fill((pos.xset - OFFSETX) * MIKRO_BIN);

                    hnhitsy[channel]->Fill((pos.yset - OFFSETY) * MIKRO_BIN);

                    h2d[channel]->Fill((pos.xset - OFFSETX) * MIKRO_BIN, (pos.yset - OFFSETY) * MIKRO_BIN);

                    if (position(pos.xset-OFFSETX, pos.yset-OFFSETY, channel)) {

                      h_ch33->Fill(pos.xset-OFFSETX, pos.yset-OFFSETY);

                      h_threshold->Fill(channel, thr.threshold/1000.0);

                      h_bias->Fill(channel, bias.bias/1000.0);

                    }

                  }

                  //gV673A->Fill(data,channel);

                  //gsumV673A[channel/16]->Fill(data);

                }

              }

              if (last_dat) break;

            }        

          } // if (recid== 0x140 || recid== 0x141)

          ii += len;

        } //while

                                break;

                  case THRREC_ID:

                    status = gzread(dfp, (voidp)&readbuf[2], (rec_len-2*ulsize));

                    thrrec = (THRREC*) readbuf;

                    thr = *thrrec;

                    if (dbg) printf("THRREC id = %d len = %d threshold %d\n",

                                    thrrec->id, thrrec->len, thrrec->threshold);

                    break;

                        case ENDREC_ID:

                                gzread(dfp, (voidp)&readbuf[2], (rec_len-2*ulsize));

                                endrec = (ENDREC *) readbuf;

                        case BIASREC_ID:

                          status = gzread(dfp, (voidp)&readbuf[2], (rec_len-2*ulsize));

                          biasrec = (BIASREC*) readbuf;

                          bias = *biasrec;

                          if (dbg) printf("BIASREC id = %d len = %d bias %d\n",

                                          bias.id, bias.len, bias.bias);

                          break;       

                                if(dbg) {

                                        printf("ENDREC_ID\n");

                                        printf("id = %d, len = %d, time = %d\n", endrec->id, endrec->len, endrec->time);

                                } else printf(" ENDREC\n");

        fcount++;

        switch(ftype-1) {

            case 0:

              sprintf(dfile, "./data/%s_file%02d.dat", dfile0, fcount);

              break;

            case 1:

              sprintf(dfile, "./data/%s_file%02d.dat.gz", dfile0, fcount);

              break;

            case 2:

              sprintf(dfile, "./data/%s_file%02d.gz", dfile0, fcount);

              break;

          }

        if(dfp) gzclose(dfp);

        dfp=gzopen(dfile,"rb");

        if(!dfp) {

          printf("      Cannot open data file: %s ---> Exiting\n", dfile);

                end_of_file = 1;

        } else {

          printf("      Opened data file: %s\n", dfile);

          end_of_file = 0;

        }

                                break;

                        default:

                                printf("switch(rec_id): default !!!\n");

                                end_of_file = 1;

                                break;

                }

                ceve++;

                if ( (ceve%50000) == 0) printf("        Current event = %d\n", ceve);

                //if(dbg) if( ceve>dbg ) break;

                if (end_of_file) break;

  }

        if(dfp) {

          gzclose(dfp);

          //delete dfp;

        }

        //if(dbg) return 0;     

        if(rootfile.IsOpen()) {

          nt->Write();

                rootfile.Write();

                printf("Saved to %s\n", fnameroot);

                rootfile.Close();

                //delete rootfile;

        }              

        return 0;

}

int position(int x, int y, int channel)

{

  int flag = 0;

  if ( (x > (padCenter[channel][0] - 5000)) and (x < (padCenter[channel][0] + 5000)) and

      (y > (padCenter[channel][1] - 5000)) and (y < (padCenter[channel][1] + 5000)) ) flag = 1;

  return flag;

}